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[Multiwfn使用咨询] 求助:关于探针半径的疑问

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请问我在用Multiwfn计算孔尺寸的时候,这里设置的1.8可以认为就是类似参考文献的说法,我们是采用1.8埃的范德华半径作为探针球来计算获得孔径和孔自由体积吗

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
Lisy 发表于 2026-1-19 10:34
谢谢您,那请问这个探针球的尺寸一直在变是吗,因为体系不同原子的范德华半径不一样

认真把下文第3节的原理介绍部分看了,自然就知道是什么意思
使用Multiwfn图形化展示分子动力学模拟体系中的孔洞、自由区域
http://sobereva.com/539http://bbs.keinsci.com/thread-16491-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
pal 发表于 2026-1-19 09:03
一个是1.8埃,一个是原子范德华半径(不同原子不同)的1.8倍,为啥认为是一样的

谢谢您,那请问这个探针球的尺寸一直在变是吗,因为体系不同原子的范德华半径不一样

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
一个是1.8埃,一个是原子范德华半径(不同原子不同)的1.8倍,为啥认为是一样的

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