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[Molclus] molclus+gaussian优化的时候,报错Error: segmentation violation

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老师们好,请问一下大家,我在测试molclus+gaussian优化的时候,发现一直报错。例子是用的sob老师讲“”使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索“”知识中的3.5 molclus+Gaussian做优化下的molclus_G09_M062X_6-31Gx.rar文件。在测试的时候发现报错如下1的问题。随后跑作业时替换了为settings2.ini文件(为molclus_1.13_Linux解压包中的settings.ini的文件同时修改了对应的iprog,gaussian_path,igaucontinue,),出现了如下2的报错, 想着是内存的问题,但是关于template.gif文件中的%nprocs和%mem也测试了改大一些和小一些(16和60GB、4和10GB),但是依旧报错,看到这个报错“Error: Optimization did not normally finish!The optimization failed because number of allowed steps is exceeded. Generate new gau.gjf with the last unconverged geometry based on template2.gjf”想着是template2.gif中的maxstep=2设置的较小,也改大了一些进行测试依旧报这样的错误。

1.png (96.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

1.png

2-1.png (111.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

2-1.png

2-2.png (99.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

2-2.png

settings.ini

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settings2.ini

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template.gjf

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template2.gjf

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traj.xyz

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-16 09:09:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-3-15 02:44
那叫gjf
没事甭在opt里写tight,会导致总耗时比默认高很多,而且明显更难达到收敛限
你的.out文件不完 ...

好的,感谢老师!

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发表于 Post on 2026-3-15 02:44:41 | 只看该作者 Only view this author
zylaaa 发表于 2026-3-14 08:47
老师您看一下,这个是gif和out文件

那叫gjf
没事甭在opt里写tight,会导致总耗时比默认高很多,而且明显更难达到收敛限
你的.out文件不完整没法判断(settings.ini里ibkout设1可以保留每个体系的out文件),但几何优化任务最后能看到l9999报错几乎一定是几何优化没收敛所致,参考下文量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-14 09:39:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zylaaa 于 2026-3-14 09:41 编辑
sobereva 发表于 2026-3-14 08:06
molclus把每一步干的事、调用计算程序运行的命令都明确给出了,按照基本逻辑排查和解决就完了
像是这个提 ...

老师,这个运行完之后gif和out都被删掉了,我截取了一下中间过程中生成的gif和out文件您看一下,我自己有点没看明白倒是是啥错误。但是最后倒是也有isomers.xyz生成,不知道这种情况是啥意思了。

gau.out

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gau.gjf

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isomers.xyz

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-14 08:47:47 | 只看该作者 Only view this author
老师您看一下,这个是gif和out文件

gau.gjf

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gau.out

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发表于 Post on 2026-3-14 08:06:00 | 只看该作者 Only view this author
molclus把每一步干的事、调用计算程序运行的命令都明确给出了,按照基本逻辑排查和解决就完了
像是这个提示,明显就是g16运行gau.gjf出错,显然应该打开gau.out看到底是什么问题、反复调试确保手动运行截图里相同的g16命令没问题然后再用molclus跑。如果搞不明白就应当把gau.gjf和gau.out上传,因为这是和报错关系最直接的文件
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