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[GROMACS] 求助:使用duIvyTools绘制FEL坐标轴问题

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本帖最后由 xylhl 于 2026-3-15 12:27 编辑

使用duIvyTools可视化FEL出现问题
使用
gmx sham -tsham 310 -nlevels 100 -f output.xvg -ls gibbs.xpm -g gibbs.log -lsh enthalpy.xpm -lss entropy.xpm
生成gibbs.xpm
然后使用duIvyTools可视化后坐标轴刻度显示出现如图问题

dit xpm_show -f gibbs.xpm

dit xpm_show -f gibbs.xpm -m 3d
不是0就是1,本来应该是0.1,0.2之类的,1.41,1.45等,全显示了1位数,这是什么原因,如何解决?为什么没有显示小数点后面的位数?


gibbs.xpm

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-15 13:11:47 | 只看该作者 Only view this author
lyj714 发表于 2026-3-15 12:49
dit xpm_show -f gibbs.xpm --x_precision 2 --y_precision 2

另外,请教一下,请问一下,FEL分析需不需要消除蛋白平动和转动后再生成xpm

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-15 13:09:15 | 只看该作者 Only view this author
lyj714 发表于 2026-3-15 12:49
dit xpm_show -f gibbs.xpm --x_precision 2 --y_precision 2

太感谢了

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发表于 Post on 2026-3-15 12:49:58 | 只看该作者 Only view this author
dit xpm_show -f gibbs.xpm --x_precision 2 --y_precision 2

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