IGMH的方法分析位阻只有绿色等值面，还有别的办法吗

李唯一

结构优化完再进行IGMH分析是不是就看不了位阻效应了，想比较三个苯基吡啶配体与过渡金属Ru配位的位阻，4-苯基吡啶倒是可以看见红色等值面，其他两个只能看见绿色的，gibbs自由能已经算过了，想问下还有其他办法能比较位阻吗

sobereva

结构优化过程中会尽可能释放位阻造成的斥力，如果在优化过程中斥力能释放得充分、没有额外束缚/阻碍导致无法释放斥力，则优化完的结构里IGMH等值面就不会显示出偏红的暗示位阻的地方
你当前的图里绿色区域本来就没什么位阻，顶多说是相对拥挤、没有空隙。如果你想体现分子各个区域有没有空隙因而有机会让其它分子接触（特别是接触中心金属），可以绘制范德华表面（常用电子密度0.001 a.u.或0.002 a.u.等值面定义），或者下文的做法
使用Multiwfn绘制分子和固体表面的距离投影图
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