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[CP2K] 求助CP2K做AIMD研究高浓度水溶液体系的流程问题

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各位大神,新手刚开始学习cp2k的AIMD的模拟,摸索了一段时间,想学习AIMD和实验测试的进行结合,目的是得到平衡后的溶剂化结果,最多需要扩散系数。我先MS搭建模拟的高浓度(3~20 mol/kg)的不同电解质(如LiNO3,NaNO3,KNO3)体系的盒子(由于密度相差很大,搭建的时候考虑实验的密度,盒子一般大于15个埃,原子数500左右),然后选择COMPASIII力场进行MD得到初始结构: 运用此结构可以直接到CP2K固定晶胞选择OPT优化,得到合理的结构:1。直接进行NVT系综的模拟吗?还是2:需要先用经典的NPT预平衡后再NVT计算? 谢谢!~


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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
花非花 发表于 2026-4-8 17:47
谢谢SOB大神!您的帖子我拜读过了。我的研究方向和主要内容还是在实验,AIMD只是补充。这样我是不是偷懒一 ...

取决于审稿人是否是内行
内行审稿人可能会怀疑M$得到的稳定晶胞尺寸是否合理,导致CP2K的NVT其实是在比如很高压下跑的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
谢谢SOB大神!您的帖子我拜读过了。我的研究方向和主要内容还是在实验,AIMD只是补充。这样我是不是偷懒一点,采取MS去做NPT稳定晶胞,然后去CP2K-固定晶胞OPT----低温预热 ------300K正式开跑NVT?谢谢!~!

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
如果怀疑力场下MD得到的密度不合理,CP2K做NVT MD前显然得先经过NPT的MD

更多信息参考
谈谈做分子动力学模拟什么时候适合用NPT和NVT系综
http://sobereva.com/761http://bbs.keinsci.com/thread-57835-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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