模拟界面的放热过程问题

downpuor

各位老师好，我想参照文献(Doctor-blading-assisted interfacial polymerization for green and scalable polyamide membrane fabrication | Nature Communications)进行一下界面聚合反应过程中放热反应模拟，观察放热在界面的扩散，以及放热对界面稳定性的影响情况等。文献的方法是根通过在盒子中放着加热板和冷却板，对加热板添加加热速度使其向水和IL侧进行热传质，我想知道这个加热板和冷却板是怎么设置的，是人为的在界面处自行添加吗？以及怎么给这加热板单独添加加热速率呢? 该类反应涉及反应力场吗，我看文献使用的是LAMMPS软件，GROMACS软件可以实现吗？

downpuor

sobereva 发表于 2026-4-21 07:49
gromacs超级适合，比lammps快多了也流行多了。这是物理过程，跟反应毫无关系（按你的意思，当前并不着重考 ...

老师补充了图三和图四，我主要是想根据文献模仿不同体系界面不同传热速率和温度分布情况。我看文献是通过给加热板的施加加热速度让这部分原子去进行热扩散，这部分原子移动的时候进行局部的热传质，并且这个热传质速度是根据体系不同而不同(图3)。我目前学到的通过gromacs进行升温退火，这个速度是自己设定的，进行类似于图j的效果绘画得到的也是线性上升后就是平直的设定温度，而不是文献这样曲线的形式，而且得到的最高温度应该也是自己设定的，不是文献这样不同体系热扩散的不同程度而呈现不同的效果(图j)。我想问的是1.gromacs给原子设定控温组的时候，可以给加热板的原子设定类似的加热速度然后让原子运动的随着轨迹进行热传质吗，而不是固定给一个升温目标的温度？2.文献设定的冷却板能够让原子传质到冷却板附近就开始降温，这个从一侧升温到另一侧降温的效果，gromacs可以通过设定参数实现吗(图L)？3.以及如果想研究图L的这个效果图热量分布是否要自己拟合脚本？

sobereva

gromacs超级适合，比lammps快多了也流行多了。这是物理过程，跟反应毫无关系（按你的意思，当前并不着重考察聚合反应，而只是涉及传热过程而已），完全用不着昂贵的反应力场
GROMACS里可以把板上的原子单独定义成控温组，并做退火设置
模拟这个问题涉及的所有知识在北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）里都有讲