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[CP2K] 求助使用CP2K计算MXene键常数用于Gromacs模拟

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楼主
请教一下困扰我很久的问题。

我想模拟  (   TiCOFe )  组成的MXene的拉伸模拟,但是构建的top文件无法正常描述结构。
  我的模拟流程如下,请大佬们看一下问题出在哪里。

1. MXene初始晶胞文件,使用multiwfn,构建结构优化opt.inp文件。(仅结构优化,非变胞优化)
2. 优化后的.restart文件,扩胞1x2x1后得到121.pdb,并生成振动分析freq.inp文件
3. 使用CP2K运行振动分析后,得到freq.out文件
4. 将freq.out 和 121.pdb 导入sobtop构建top文件。

所有的文件,作为附件上传。
请帮忙看一下是否是哪里的参数设置有问题

MX_ori.pdb

7.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

opt-1.restart

11.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

freq.inp

11.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

opt.inp

7.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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