有没有什么分析方法可以预测单分子的异构

xujian · 发表于 Post on 2017-6-9 09:13:28

最近看了sob老师的blog关于用静电势和平均局部离子化能预测反应位点和分析分子间的相互作用，自己的课题主要关于单分子的反应，想请问一下，有没有什么分析方法可以预测分子间的反应，比如这个分子倾向于哪两个原子成键，哪两个原子断键（异构化）。

sobereva · 发表于 Post on 2017-6-25 15:13:57

xujian 发表于 2017-6-25 07:42
请问老师，有没有学习AIMD分析方法的文献推荐，没找到应该怎么具体操作的资料。

如果指高斯，网上没有AIMD的操作例子。google点资料学习基本原理，然后照着手册自行摸索。

xujian · 发表于 Post on 2017-6-25 07:42:05

sobereva 发表于 2017-6-9 10:19
不是单分子反应么？怎么又牵扯到双分子了
分子间反应哪两个原子容易成键，可以靠前线轨道理论，或者更好的 ...

请问老师，有没有学习AIMD分析方法的文献推荐，没找到应该怎么具体操作的资料。

xujian · 发表于 Post on 2017-6-9 10:59:38

sobereva 发表于 2017-6-9 10:19
不是单分子反应么？怎么又牵扯到双分子了
分子间反应哪两个原子容易成键，可以靠前线轨道理论，或者更好的 ...

谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2017-6-9 10:19:32

不是单分子反应么？怎么又牵扯到双分子了
分子间反应哪两个原子容易成键，可以靠前线轨道理论，或者更好的，概念密度泛函理论中定义的双描述符（同时计算两个反应物分子的双描述符，然后去对照）
如果是异构化，可以靠键能、柔性力常数、键级等指标考察哪个键比较容易断，但这终究只是提供一个辅助，到底怎么异构化容易还得实际算算势垒，或者跑AIMD

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[综合交流] 有没有什么分析方法可以预测单分子的异构