北京科音分子动力学与GROMACS培训班的详细内容（不断更新）

sobereva · 发表于 Post on 2018-1-25 14:23:54

把“北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 讲授的内容做了个纲要，便于想参加者了解培训内容，以及和市面上其它坑钱培训进行对比，避免上当
http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html
随着培训班内容不断改进和扩展，此网页内容也不断更新。

PS：培训其它相关信息参见http://www.keinsci.com的“科研培训”栏目。常见问题看《北京科音办的培训班FAQ》（http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html）

北京科音历届举办的此系列培训的回顾和学员心得见：http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=forumdisplay&fid=43&filter=typeid&typeid=248

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-1 23:37:07

AaronBlacknine 发表于 2024-10-1 16:23
老师，我想报名这次的gromacs的培训班，想具体询问一下，课程中是否会涉及蛋白和ssDNA复合物的分子动力学模 ...

里面有超详细的蛋白质模拟的介绍和例子，北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）内容介绍里写了

培训里也专门讲DNA的模拟，虽然没有直接给出少见的ssDNA的情况，但你只需要把pdb文件里的一条链删掉，照常模拟就行，计算上没有任何特殊性

AaronBlacknine · 发表于 Post on 2024-10-1 16:23:20

老师，我想报名这次的gromacs的培训班，想具体询问一下，课程中是否会涉及蛋白和ssDNA复合物的分子动力学模拟，因为自己是做这个方向的，想重点学习一下这个方面的内容

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-4 02:43:09

liu_cpu 发表于 2023-3-3 21:51
请问sob老师，往届的资料和官网通知的近期4月举办的gromacs培训班的资料差别大吗？

不大

liu_cpu · 发表于 Post on 2023-3-3 21:51:45

请问sob老师，往届的资料和官网通知的近期4月举办的gromacs培训班的资料差别大吗？

sobereva · 发表于 Post on 2023-2-15 05:37:15

想喝可乐发表于 2023-2-13 15:58
sob老师今年大概啥时候举办啊

北京科音办的培训班FAQ
http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html

想喝可乐 · 发表于 Post on 2023-2-13 15:58:32

sob老师今年大概啥时候举办啊

sobereva · 发表于 Post on 2022-10-16 03:56:51

bxc 发表于 2022-10-15 21:56
大量分子动力学研究者迫切需要分子动力学高级班的课程学习呀，sob老师可以再往前提提日程吗，或许可以提在 ...

不可能往前提

bxc · 发表于 Post on 2022-10-15 21:56:56

大量分子动力学研究者迫切需要分子动力学高级班的课程学习呀，sob老师可以再往前提提日程吗，或许可以提在像第十届***这类课程前边，太刚需了@sobereva

lhx-xwzj · 发表于 Post on 2021-10-8 10:47:25

sobereva 发表于 2021-10-8 10:41
不是“吸附用蒙特卡罗更合适”，而是蒙特卡罗在吸附方面用得很多
分子动力学也完全可以研究吸附问题，而 ...

好的好的，明白了，我先好好复习初级量化班的内容，谢谢老师！

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-8 10:41:01

lhx-xwzj 发表于 2021-10-8 10:11
刚参加完初级量化培训班，太崇拜卢老师了，很想继续参加分子动力学培训班，但十一月份的没时间了，而且需要 ...

不是“吸附用蒙特卡罗更合适”，而是蒙特卡罗在吸附方面用得很多
分子动力学也完全可以研究吸附问题，而且也非常普遍，你用google学术搜搜研究文献便知。和蒙特卡罗的研究有互补性。动力学培训不专门讲蒙特卡罗计算，只不过简单说一下思想而已

初级量化班都是从最基本知识开始详细讲解，所有对计算有直接关系的背景信息全都很详细地在课上交代了，原理+关键词+计算技巧全都有，而且例子给得很丰富，多复习几遍绝对100%全都能搞懂。所以我为什么特别在课程最后强调一定要复习，而且特意强调对于零基础初学者至少一个字一个字复习三遍。

没什么适合提前看的，此文靠后部分说了
北京科音办的培训班FAQ
http://bbs.keinsci.com/thread-5098-1-1.html

lhx-xwzj · 发表于 Post on 2021-10-8 10:11:09

刚参加完初级量化培训班，太崇拜卢老师了，很想继续参加分子动力学培训班，但十一月份的没时间了，而且需要一些时间先把量化培训班的知识消化一下，之前从没接触过分子动力学模拟，记得量化培训班里老师说吸附用蒙特卡罗更合适，看到分子动力学培训班简介里也有蒙特卡洛简介，想问问卢老师分子动力学培训班对蒙特卡罗的介绍能不能达到应用计算的水准，还有就是量化培训班给我的感觉就是之前自己尝试算过的部分，就能完全听得懂，没接触过的就有点听不懂了，所以对于分子动力学有什么基础知识需要提前学习的吗，争取明年参加分子动力学，自费我也愿意，膜拜！

sobereva · 发表于 Post on 2020-12-17 10:26:30

tienan0412 发表于 2020-12-16 23:31
请问老师会不会举办VMD的培训班？

分子动力学与GROMACS培训班超级详细讲VMD，本帖1L给出的内容介绍里已经明确说了http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html

光一个VMD显然不可能开个培训班，本身既不是能独立用的计算程序，能讲的东西的信息量也根本不够作为一个单独的培训

tienan0412 · 发表于 Post on 2020-12-16 23:31:24

请问老师会不会举办VMD的培训班？

tuzhidingdong · 发表于 Post on 2020-10-9 22:44:51

刚参加了初级班，期待进阶分子动力学，跟sob上分儿

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[综合交流] 北京科音分子动力学与GROMACS培训班的详细内容（不断更新）

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