计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9196|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[xtb] xtb固定原子优化失败

[复制链接 Copy URL]

53

帖子

0

威望

670

eV
积分
723

Level 4 (黑子)

采用GNF-xtb优化一个有机分子和一个水分子的体系,我按照Grimme提供的HOWTO手册上说明,试了三种方法:1.拷贝一份xyz文件为fix文件,并在水分子的氧原子后面设定了f字符表示固定

2.在xtbrc里面设定fix 85(我固定的氧原子的序号),然后设定fixfc 0
3.组合使用两种方法
结果发现优化后水分子偏离初始设定的位置,请教大家有什么解决方案么?

test.png (49.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 55)

test.png

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2018-4-18 03:51:26 | 只看该作者 Only view this author
你只固定了一个原子吗?那想象起来和不固定应该是完全一样的。无非是水跑过去还是别的东西跑到水面前来的区别

评分 Rate

参与人数
Participants 4
eV +8 收起 理由
Reason
masgils + 1 233333
wbn + 3 233333
ABetaCarw + 3 对哟,冻结一个原子和没冻结没区别的(从构.
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 20:16 , Processed in 0.169051 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list