求助保存VMD环境时遇到的问题

qianbao · 发表于 Post on 2018-9-4 10:31:13

用VMD观看电荷转移情况时，每次打开都是各种调节很麻烦，所以想按照帖子里面save visualization state。不知道是不是自己理解错误：
1、“在你完全设定好观看等值面的显示方式后，选择Extensions-Visualization-View Master，然后点Create New，再选File-Save as，然后保存为比如ViewMO.tcl，这个文件里就包含了你之前调节显示方式的每一步操作。”
我的操作：打开一个cub文件，设定（背景颜色以及等值面等）好后，直接进行Extensions等操作。
2、“下回再想看轨道等值面的时候，只需在VMD里选择File-Load visualization state，然后选择那个.tcl文件，之前的显示方式设定就会完全恢复。”
这样确实打开了之前的分子轨道
3、“不过，如果你的cube文件路径和之前的不同，应该用文本编辑器打开那个.tcl文件，将第五行的cube文件路径改为实际的。”
这个都是在一个文件下的
4、“另外，如果cube文件内容发生了变化，通过载入.tcl恢复显示方式后，等值面可能并没有在图形窗口中出现，此时稍微调节一下设定即可，比如改一下Isovalue，或者把Step从默认的1改为2，等值面就又出现了，然后再把设定改回去即可。”
我的操作：打开第二个cube文件，load visualization state（是载入.tcl的操作吧？）打开刚才保存的环境，就出现了两个这样的。
所以，不知道是否可以直接保存一个环境，让我下次打开另一个可以不用设定那么多。

sobereva · 发表于 Post on 2018-9-4 11:40:32

用文本编辑器打开visualization state，试图理解里面各个条目的含义，怎么修改能达到期望的效果不言自明

qianbao · 发表于 Post on 2018-9-4 14:08:48

好的，谢谢老师！已清楚！

18783980657 · 发表于 Post on 2019-2-27 17:30:23

qianbao 发表于 2018-9-4 14:08
好的，谢谢老师！已清楚！

请问下，保存之后的tcl文件，再次打开后能灵活旋转吗？和Gview一样吗？

sobereva · 发表于 Post on 2019-2-27 21:01:43

18783980657 发表于 2019-2-27 17:30
请问下，保存之后的tcl文件，再次打开后能灵活旋转吗？和Gview一样吗？

可。
保存的不是图片，而是绘制状态，显然还能旋转

qianbao · 发表于 Post on 2019-3-18 09:35:29

18783980657 发表于 2019-2-27 17:30
请问下，保存之后的tcl文件，再次打开后能灵活旋转吗？和Gview一样吗？

按照老师帖子里的打开方式，再打开就是原来您设置的样式；如果存为模板的话，套入一个新的分子，只需要改一下新分子的位置，也得到相同的设置

qianbao · 发表于 Post on 2019-5-10 19:26:34

18783980657 发表于 2019-2-27 17:30
请问下，保存之后的tcl文件，再次打开后能灵活旋转吗？和Gview一样吗？

可以的，就是一个模板，套上模型后，就能正常操作

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