lammps 能量计算出现问题

Recycled · 发表于 Post on 2019-5-5 10:21:03

各位前辈好！
我尝试运行了moltemplate软件自带的opls-aa力场的正丁烷算例（260k，1atm），计算结果中内能/焓值相较于NIST数据小50%左右；当升高了了计算的温度、压力之后，能量值的结果偏差更加大，且变化的范围为1-5kcal/mol（NIST数据给出的变化范围在2-17kcal/mol）。
我尝试修改了special_bonds的参数以控制1-2和1-3相互作用的计算，尽管结果发生了改变，但我并不认为这样的修改是正确的。此外，我也尝试了初始速度的修正或fix_modify命令，这些都不奏效。因此希望请教各位是否出现过类似的问题？以及问题可能的原因及解决方案。

谢谢大家！

chenxia12 · 发表于 Post on 2019-10-29 11:38:50

你好，想请教一下如何运行moltemplate呢，非常感谢

Recycled · 发表于 Post on 2019-11-5 10:28:33

chenxia12 发表于 2019-10-29 11:38
你好，想请教一下如何运行moltemplate呢，非常感谢

http://www.moltemplate.org/visual_examples.html
软件官网自带的教程已经十分清楚明确了，只要不是十分复杂的分子我相信这些教程足够了（甚至不需要manual）
复杂分子我也不会。。。

chenxia12 · 发表于 Post on 2020-2-14 11:01:36

Recycled 发表于 2019-11-5 10:28
http://www.moltemplate.org/visual_examples.html
软件官网自带的教程已经十分清楚明确了，只要不是十 ...

谢谢

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