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[NBO相关] 求助,NBO分片段问题

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最近对一些开壳层体系做NBO中的二阶微扰理论分析,可是总是分不开片段,用Gaussian进行NBO计算时怎样分片段呢?特别是开壳层的计算。我做了一个输入文件,请sob老师看一下是否存在问题?另外,想问一下sob老师有没有哪种软件可以像ADF似的,直接指定分子A是一个片段分子B是一个片段?

NBO的输入文件和输出文件示例.zip

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发表于 Post on 2019-7-5 12:37:17 | 只看该作者 Only view this author
我不晓得你要分片段是什么目的、想得到什么
输入文件本身没问题,但记住用UMP2做开壳层体系的计算是非常糟糕的选择,而且后HF不加density,传给NBO模块的是HF级别的密度矩阵,非常糟糕
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-5 15:25:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-5 12:37
我不晓得你要分片段是什么目的、想得到什么
输入文件本身没问题,但记住用UMP2做开壳层体系的计算是非常糟 ...

首先谢谢sob老师的指导。
我分片段的主要目的:例如附件中的复合物,通过把OHH2P认为是分子片段1,CH3认为是分子片段2,我希望在二阶围绕能分析中可以找到片段1到片段2 或者片段2到片段1的轨道作用。

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发表于 Post on 2019-7-5 16:48:40 | 只看该作者 Only view this author
就是用CHOOSE。你当前CHOOSE设的没错
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-5 19:44:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-5 16:48
就是用CHOOSE。你当前CHOOSE设的没错

好的,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2019-7-5 22:57:25 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
枕上卢生 发表于 2019-7-5 15:25
首先谢谢sob老师的指导。
我分片段的主要目的:例如附件中的复合物,通过把OHH2P认为是分子片段1,CH3认 ...

采用Chem. Eur. J. 2018, 24, 9639和Phys. Chem. Chem. Phys., 2018, 20, 13792里的方法,可基于NBO框架直接计算两分子片段的作用能,无需二阶微扰近似

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发表于 Post on 2019-7-6 17:19:58 | 只看该作者 Only view this author
如果不是非得用E2的话,用PSI4跑个SAPT来说明问题强得多得多
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-8 08:44:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-6 17:19
如果不是非得用E2的话,用PSI4跑个SAPT来说明问题强得多得多

好的,十分感谢sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-8 08:44:37 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-7-5 22:57
采用Chem. Eur. J. 2018, 24, 9639和Phys. Chem. Chem. Phys., 2018, 20, 13792里的方法,可基于NBO框架 ...

谢谢啦

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