如何实现分子沿两个不同方向的角度同时旋转？

mozixingchen · 发表于 Post on 2019-11-1 19:15:21

本帖最后由 mozixingchen 于 2019-11-1 19:15 编辑

如题，最近看到这篇文献，这里面的旋转看起来很复杂，可以实现两个角度同时旋转并计算得到数据，此外还可以沿着不同的方向如[010]、 [111]等去旋转。
Q1:文献中计算方法部分只提到了vasp，那么这些计算是只用vasp就能实现的吗？

Q2:如图14a和15这种沿着θ和φ两个不同方向上同时旋转要怎样才能实现？如何得到这种二维的数据？

Q3:如图12的结果，如何让客体MA分子沿着想要的轴去旋转和平移，譬如：[100]、[010]、[111]等，怎么做？

Q4:如图14b中，这么完整的势能面是如何得到的？Polar plot of orientational energy surface这个是什么意思？

以上每个问题对我这个新手来说都是非常难的点，请各位老师不吝赐教，知无不言言无不尽，不胜感激！

hxd_yi · 发表于 Post on 2019-11-1 21:15:27

我猜文章中用到了四元数进行旋转操作（因为旋转角它用2alpha表示），建议您看一下如何通过使用四元数的运算完成旋转。

granvia · 发表于 Post on 2019-11-1 21:29:51

hxd_yi 发表于 2019-11-1 21:15
我猜文章中用到了四元数进行旋转操作（因为旋转角它用2alpha表示），建议您看一下如何通过使用四元数的运算 ...

把极坐标说得这么高大上:D

mozixingchen · 发表于 Post on 2019-11-4 09:21:05

本帖最后由 mozixingchen 于 2019-11-4 09:22 编辑

granvia 发表于 2019-11-1 21:29
把极坐标说得这么高大上:D

谢谢老师回复！请问您能具体说一下吗？顺便能否请您也回答一下我其它的问题吗？多谢多谢！

mozixingchen · 发表于 Post on 2019-11-4 09:21:41

hxd_yi 发表于 2019-11-1 21:15
我猜文章中用到了四元数进行旋转操作（因为旋转角它用2alpha表示），建议您看一下如何通过使用四元数的运算 ...

谢谢您的回复！

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