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[GROMACS] 关于GROMACS联动软件安装的提问(g_permute)

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Level 5 (御坂)

当使用GROMACS对水盒子体系进行熵值计算时,由于水的扩散性,导致GROMACS自带的,常用来分析生物体系的准谐波分析方法不能应用于此,因此试图安装其他科研工作者开发的软件,但是总是有错误,所以想问问有没有会安装的人指点一二。
我上传了一些附件:其中1号安装包是作者给出的软件压缩包,2号安装包是作者当时使用的老版本fftw,3号安装包是作者当时使用的老版本GROMACS,安装文献是作者对于软件安装的教程,原理文献是方法原理。

我按照作者的安装文献教程安装,但是总会有一些报错,如图一;

作者给出的模板我觉得有点奇怪,如图二;这三个路径说是GROMACS安装后的文件夹下,但是第二个路径的src文件夹应该不是安装后的,而是安装包解压缩后得到的带有源码的文件夹。但是我们试了各种情况后仍然无法编译成功,所以在此请教各位。

想问问有没有人可以说一下成功编译+安装所需要的注意事项,谢谢





微信截图_20191119152322.png (28.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

图一

图一

2.png (12.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

图二

图二

aecj_v1_0.tar.gz

2.61 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

1号安装包

permutation_reduction.pdf

1.44 MB, 下载次数 Times of downloads: 5

原理文献

g permute.pdf

497.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

安装文献

fftw-3.1.2.tar.gz

2.61 MB, 下载次数 Times of downloads: 0

2号安装包

gromacs-3.3.1.tar.gz

7.62 MB, 下载次数 Times of downloads: 0

3号安装包

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