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[新手求助] 混合溶剂该选用哪种溶剂模型?比如乙腈:H2O=9:1的比例

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“SMD模型不适合自定义溶剂。因为此模型计算非极性部分的公式依赖于溶剂的多种物性参数,光定义eps、epsinf是不够的,而SMD依赖的溶剂的一些其它属性(如酸度)又没法往Gaussian里定义”


上面这句话是sob老师之前帖子里说到的,SMD模型不适合自定义溶剂,但如果需要自定义的话该选用什么隐式溶剂模型呢?

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发表于 Post on 2019-11-23 23:53:22 | 只看该作者 Only view this author
不管是Gaussian里什么隐式溶剂模型,只要考虑非极性部分,就需要定义eps、epsinf以外的参数,都很难对溶剂进行完整定义(缺参数)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-26 23:49:32 | 只看该作者 Only view this author
[quote][url=forum.php?mod=redirect

sob老师 刚刚看了您更新的关于计算溶剂自由能的帖子 里面讲到混合溶剂在SMD下自定义的部分 乙腈和水是常见的高斯内置的溶剂,这两个混合的话应该可以定义完整的参数同时计算极性部分和非极性部分吧 苏尼明达里应该有这两个溶剂的完整参数 取加权平均值,这样计算行吗?

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发表于 Post on 2019-11-27 01:51:39 | 只看该作者 Only view this author
linima 发表于 2019-11-26 23:49
[quote][url=forum.php?mod=redirect

sob老师 刚刚看了您更新的关于计算溶剂自由能的帖子 里面讲到混合溶 ...

可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-27 12:08:02 | 只看该作者 Only view this author

感谢sob老师回复,我查了一下苏尼明达发现水没有完整的参数 好不合理啊,水很常见的溶剂呀

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发表于 Post on 2019-11-28 02:26:07 | 只看该作者 Only view this author
linima 发表于 2019-11-27 12:08
感谢sob老师回复,我查了一下苏尼明达发现水没有完整的参数 好不合理啊,水很常见的溶剂呀:dizzy ...

是明尼苏达
看原文就知道水在SMD模型里是一个特例
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发表于 Post on 2020-11-11 13:55:21 | 只看该作者 Only view this author
您好,请问像您这个溶剂的比例是9:1应该怎么设置?

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发表于 Post on 2020-11-11 15:40:40 | 只看该作者 Only view this author
ZnPMg 发表于 2020-11-11 13:55
您好,请问像您这个溶剂的比例是9:1应该怎么设置?

按三楼说的方法就行了
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发表于 Post on 2020-11-14 16:46:40 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-11 15:40
按三楼说的方法就行了

感谢您的回复。
Sob老师的帖子里说:对于混合溶剂,应该将几种溶剂的eps和epsinf按照体积比例进行混合来定义自定义溶剂。

对于乙腈:水=9:1
自定义的esp是否等于:9*eps(乙腈)+1*eps(水)
自定义的epsinf是否等于:9*epsinf(乙腈)+1*epsinf(水)

高斯自带的溶剂给出的介电常数Water: ε=78.3553;Acetonitrile: ε=35.688是eps还是epsinf?

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发表于 Post on 2020-11-14 20:16:45 | 只看该作者 Only view this author
ZnPMg 发表于 2020-11-14 16:46
感谢您的回复。
Sob老师的帖子里说:对于混合溶剂,应该将几种溶剂的eps和epsinf按照体积比例进行混 ...


是eps,epsinf一般比eps小,对于强极性溶剂更是小得多
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发表于 Post on 2020-11-15 08:25:48 | 只看该作者 Only view this author
ZnPMg 发表于 2020-11-14 16:46
感谢您的回复。
Sob老师的帖子里说:对于混合溶剂,应该将几种溶剂的eps和epsinf按照体积比例进行混 ...

显然是0.9和0.1的混合比

各种溶剂的epsinf都在3以下,几十的显然是eps。没说是epsinf的情况一律是eps
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发表于 Post on 2020-11-15 11:09:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-15 08:25
显然是0.9和0.1的混合比

各种溶剂的epsinf都在3以下,几十的显然是eps。没说是epsinf的情况一律是eps

我看到9和1自动脑补成0.9和0.1了。。。希望没有误导
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发表于 Post on 2020-11-19 10:55:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-14 20:16

是eps,epsinf一般比eps小,对于强极性溶剂更是小得多

谢谢您的回复

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发表于 Post on 2020-11-19 11:00:13 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-15 11:09
我看到9和1自动脑补成0.9和0.1了。。。希望没有误导

谢谢,应该是对的。
查了一下加权平均数,https://baike.baidu.com/item/%E5 ... 0366&fr=aladdin
如果加权,体积看看成是权,体积比为乙腈:水=9:1
则加权平均值为:【9*epsinf(乙腈)+1*epsinf(水)】/(9+1)=0.9*epsinf(乙腈)+0.1*epsinf(水)

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发表于 Post on 2020-11-19 14:56:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ZnPMg 于 2020-11-19 16:07 编辑

先只用一种溶剂,例如:#p M062X/6-31G(d,p) SCRF=(smd,solvent=Acetonitrile),简单算一下,.log文件中会出现该溶剂的Eps和Eps(inf)值。
Solvent              : Acetonitrile, Eps=  35.688000 Eps(inf)=   1.806874
Solvent              : Water, Eps=  78.355300 Eps(inf)=   1.777849
V(Acetonitrile:Water)=9:1  混合溶剂的Eps=35.688*0.9+78.355300*0.1=39.95473;Eps(inf)=0.9*1.806874+0.1* 1.777849=1.8039715





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