计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8244|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] MS保存的cif格式模型结构发生变化求助

[复制链接 Copy URL]

72

帖子

0

威望

551

eV
积分
623

Level 4 (黑子)

图1是我用MS搭建的石墨炔原胞模型。我另存为了cif格式,再次用MS打开cif格式时,它的结构却发生了变化,化学键变了,如图2。
我用VESTA软件将cif格式的文件转换成POSCAR格式,然后用VASP作第一性原理计算。图3是VESTA打开后的模型示意图。
结构发生变化是我用MS建模时不够完善造成的吗,这种情况有大佬遇见过吗,我该怎么去解决呢?

图1.png (25.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

图1

图1

图2.png (34.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

图2

图2

图3.png (59.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

图3

图3

222

帖子

0

威望

4755

eV
积分
4977

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-1-13 13:07:50 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
显示问题,其实都一样

4

帖子

0

威望

23

eV
积分
27

Level 2 能力者

3#
发表于 Post on 2023-6-6 18:15:00 | 只看该作者 Only view this author
我也是这样,保存好的CIF再打开还是不对,怎么办呀 要投稿了急急急

180

帖子

0

威望

1155

eV
积分
1335

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2023-6-6 19:03:30 | 只看该作者 Only view this author
xuejialin 发表于 2023-6-6 18:15
我也是这样,保存好的CIF再打开还是不对,怎么办呀 要投稿了急急急

就是上面说的显示问题,对成键距离的判定设置不一样

4

帖子

0

威望

23

eV
积分
27

Level 2 能力者

5#
发表于 Post on 2023-6-7 17:41:50 | 只看该作者 Only view this author
pal 发表于 2023-6-6 19:03
就是上面说的显示问题,对成键距离的判定设置不一样

谢谢谢谢!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 19:36 , Processed in 2.589359 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list