ORCA单点报错求助

土拔鼠

我用的版本是ORCA 4.2.0 shared_openmpi314
openmpi只装了一个 就是openmpi314

ORCA输入文件为Multiwfn 3.7生成的  计算任务类型是单点 级别是RI-PWPB95-D3(BJ)/def2-QZVPP 加了弥散函数 体系是有机体系 96原子
输入文件中 我只修改了%maxcore 3000 和%pal nprocs  36 其他没有改动
服务器是36核 128G内存

报错信息如下
           ************************************************************           *        Program running with 36 parallel MPI-processes    *
           *              working on a common directory               *
           ************************************************************
One Electron integrals                  ... done
Pre-screening matrix                    ... done
--------------------------------------------------------------------------
Primary job  terminated normally, but 1 process returned
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 8 with PID 0 on node localhost exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------


ORCA finished by error termination in GTOInt
Calling Command: mpirun -np 36  /home/steven/orca_4_2_0_linux_x86-64_shared_openmpi314/orca_gtoint_mpi orca200espoint.int.tmp orca200espoint
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run


[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run


请教一下大家 这可能是哪里出现问题
谢谢大家

土拔鼠

我修改了%maxcore 2500 和 %pal nprocs  30

任务可以执行一段时间 我打开Htop监测运行情况 大约2分钟之后 内存突然变成100% 然后任务就终止了

报错信息如下

           ************************************************************
           *        Program running with 30 parallel MPI-processes    *
           *              working on a common directory               *
           ************************************************************
One Electron integrals                  ... done
Pre-screening matrix                    ... done


WARNING! Potentially linear dependencies in the auxiliary basis (\J).
===>>    Running eigenvalue decompsition instead (RIFLAG[1]<0).
         This is not supported with all the options/modules.
         If the calculation crashes, please re-try with a different auxiliary basis.
--------------------------------------------------------------------------
Primary job  terminated normally, but 1 process returned
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 3 with PID 0 on node localhost exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------

ORCA finished by error termination in GTOInt
Calling Command: mpirun -np 30  /home/steven/orca_4_2_0_linux_x86-64_shared_openmpi314/orca_gtoint_mpi orca200espoint.int.tmp orca200espoint
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run

[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run

土拔鼠

相同的设置 试了一下去掉弥散函数就可以正常运行 带着弥散就会报错

我想在ORCA中用混合基组 比如1-3原子用PWPB95 D3 ma-def2-TZVPP 其余的原子用 PWPB95 D3 def2-TZVPP
请教一下各位老师改怎么设置


之前的输入关键词
! PWPB95 D3 ma-def2-TZVPP autoaux RIJCOSX grid4 gridx4 tightSCF noautostart miniprint nopop
%maxcore 3000
%pal nprocs  36 end
* xyz   0   1
C     -1.00000000   -1.17777900   -4.27820600
C      0.00000000   -0.36714300   -3.08859600
C      0.00000000   -1.23160700   -2.15474300
C      0.00000000   -0.50563400   -1.03613900
O      0.00000000    0.70675200   -0.67436000
O      0.00000000   -0.95259900   -0.41399700
C     -1.00000000   -6.31380900   -2.96895000
C      0.00000000   -6.12159000   -1.48861200
C      0.00000000   -4.67071900   -1.10265600
.
.
.
  *


谢谢各位

liyuanhe211

土拔鼠 发表于 2020-3-7 23:00
我修改了%maxcore 2500 和 %pal nprocs  30

任务可以执行一段时间 我打开Htop监测运行情况 大约2分钟之 ...

看看别用autoaux，自己给定辅助基组能不能正常运行

liyuanhe211

土拔鼠 发表于 2020-3-8 00:06
相同的设置 试了一下去掉弥散函数就可以正常运行 带着弥散就会报错

我想在ORCA中用混合基组 比如1-3原子 ...

看手册8.1.1.2节

alexanderqi

是用自己的服务器计算的还是在外面的超算上算的？使用slurm调度器的时候可能会因为mpirun的设置而出现类似的报错，可以参考https://guido.vonrudorff.de/2018/orca-in-slurm-native-mode/解决。

sobereva

用def2-QZVP

wuzhiyi

弥散的锅 去掉弥散就行

土拔鼠

liyuanhe211 发表于 2020-3-8 02:38
看手册8.1.1.2节

谢谢李老师

土拔鼠

alexanderqi 发表于 2020-3-8 12:41
是用自己的服务器计算的还是在外面的超算上算的？使用slurm调度器的时候可能会因为mpirun的设置而出现类似 ...

谢谢 收藏一下先 是用自己服务器算的

土拔鼠

sobereva 发表于 2020-3-8 14:13
用def2-QZVP

谢谢社长 我试了一下 用小基组 或者不带弥散就可以进行

土拔鼠

wuzhiyi 发表于 2020-3-8 16:48
弥散的锅 去掉弥散就行

谢谢 确实是弥散的锅 我再试试用ORCA混合基组 Gaussian算这个体系的双杂化太费时间了

土拔鼠

liyuanhe211 发表于 2020-3-8 02:38
看手册8.1.1.2节

李老师想请教您一下 我看了手册8.1.1.2 Basis Set Options
按照 CuCl4的例子

我是不是可以在按照Multiwfn生成的输入文件基础上
在我需要指定特定基组的原子坐标后面 直接加上基组信息 比如

C      0.00000000   -1.23160700   -2.15474300   newGTO "ma-def2-TZVP" end

那这个原子就会优先使用我输入的基组信息而不用上面关键词的 def2-TZVP

我试了一下 是可以运行的 但我对ORCA不是很了解心里没有底 也不知道到底有没有加弥散

还有比如autoaux RIJCOSX grid4 gridx4 noautostart miniprint nopop 这些Multiwfn生成的关键词 我在进行这种混合输入的时候需要进行特殊的改动吗？还是直接保留就可以

谢谢

wuzhiyi

土拔鼠 发表于 2020-3-8 17:54
谢谢 确实是弥散的锅 我再试试用ORCA混合基组 Gaussian算这个体系的双杂化太费时间了

def2-QZVPP高角动量其实已经有弥散性了 再加弥散意义不大

sobereva

除非算阴离子体系，否则用def2-QZVP比起ma-def2-TZVP的做法明显更适合，参看比如
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540（http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html）