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[VMD] 构造的模型或者LAMMPS输出的的轨迹文件中同一个分子之间的键没有显示应该怎样处理呢

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我用一个原子来代替一个基团建立单个分子模型,(下面的一个原子代表一个甲基或其他基团)  但是在用packmol建立好整个模型后可视化结果是单个原子  dump轨迹文件也是这样,想问这种建立联合原子模型的方法不对吗?键角键长信息在data文件里也修改了

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