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[Gaussian/gview] 求助 请问高斯跑IRC后得到的产物和反应物坐标在哪里找?

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楼主
不好意思初学高斯,请问跑完irc后反应物和产物的坐标在哪里找?

以下是我的输入文件:

%chk=methyl-TS.chk
#  IRC(RCFC,Report) tpsstpss/gen
#SCF=maxcyc=150

谢谢


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发表于 Post on 2020-3-30 23:14:01 | 只看该作者 Only view this author
IRC并不能精确得到产物和反应物结构,必须再做优化
如果你只是问两头的IRC点的坐标怎么获得,在gview里打开IRC输出文件,切换到第一帧和最后一帧,分别保存成gjf就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 23:23:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-30 23:14
IRC并不能精确得到产物和反应物结构,必须再做优化
如果你只是问两头的IRC点的坐标怎么获得,在gview里打 ...

好的谢谢。我就是想得到两头的坐标再优化。请问输出文件里应该找什么关键字?

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发表于 Post on 2020-3-30 23:41:58 | 只看该作者 Only view this author
最爱喵星人 发表于 2020-3-30 23:23
好的谢谢。我就是想得到两头的坐标再优化。请问输出文件里应该找什么关键字?

至少我的G16 B.01下,找
Calculation of FORWARD path complete.
Beginning calculation of the REVERSE path.
这个是向前的IRC找完的标志,往前找最后一次出现的Cartesian坐标即可,也就是这前面最后一次
Input orientation
后面的内容。
向后的IRC找完的标志是
Calculation of REVERSE path complete.
Reaction path calculation complete.
然后同样找这上面最后一次的坐标。
总之搜REVERSE就行。
图省事可以用卢老师开发的程序。
将Gaussian的IRC任务输出转换为.xyz轨迹文件的工具
http://sobereva.com/285
产生Gaussian的IRC和SCAN任务每个点的波函数文件的工具
http://sobereva.com/199

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-31 00:04:40 | 只看该作者 Only view this author
谢谢

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发表于 Post on 2020-3-31 02:48:42 | 只看该作者 Only view this author
最爱喵星人 发表于 2020-3-30 23:23
好的谢谢。我就是想得到两头的坐标再优化。请问输出文件里应该找什么关键字?

我已经在2L说了怎么得到。没必要自己去在输出文件里找,除非你要写脚本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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