求助如何用lammps计算聚合物体系的末端距

loading · 发表于 Post on 2020-9-14 15:30:07

请问是对体系跑动力学后输出原子坐标，再用matlab统计么？如果体系很大分子链很多，如何在输出的原子坐标文件中找到每个分子的头原子和尾原子呢？
还是有命令语句可以直接计算末端距？求指点，感谢

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-15 15:07:41

matlab根本不适合做这种事
做这种统计用VMD的tcl脚本比其它任何方式都省事，手册里就有分析脚本编写示例

loading · 发表于 Post on 2021-3-1 11:00:21

sobereva 发表于 2020-9-15 15:07
matlab根本不适合做这种事
做这种统计用VMD的tcl脚本比其它任何方式都省事，手册里就有分析脚本编写示例

谢谢sob老师指点

Achan · 发表于 Post on 2021-4-30 18:11:57

楼主找到示例了吗，指个路呗

BBiuiu · 发表于 Post on 2022-2-25 09:49:41

请问楼主会了吗？能讲解一下吗

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[Lammps] 求助如何用lammps计算聚合物体系的末端距