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[新手求助] 对不稳定的结构需要进行振动分析吗?

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各位老师好,关于计算分子的strain energy时,是否需要振动分析具有疑问。如下图所示的分子A和B,通过比较能量差求得分子A具有的分子张力,这种情况下需要做振动分析吗?对于分子A而言,其本身就不稳定,计算出来的零点能,焓等能量参数具有参考价值吗?谢谢各位老师的解答。

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发表于 Post on 2020-10-15 20:49:38 | 只看该作者 Only view this author
这个分子结构在势能面上是在什么位置

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-15 20:57:31 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2020-10-15 21:49
这个分子结构在势能面上是在什么位置

不是驻点的位置
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发表于 Post on 2020-10-15 21:34:50 | 只看该作者 Only view this author
没必要。
如果你有IRC,可以计算垂直于IRC方向的所有振动模式对零点能、Gibbs自由能的贡献,不过对于一般的研究没必要做得这么精细,一般只有算KIE之类的对势能面极为敏感的计算才需要这么做
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2020-10-16 02:28:47 | 只看该作者 Only view this author
一般量化研究里,非驻点的振动分析有意义的情况主要是变分过渡态理论研究中对过渡态周围的结构做振动分析获得自由能,以及根据特殊结构的虚频判断是否适合作为过渡态初猜、如何消虚频之类的目的。你提到的情况没有做振动分析的意义。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-16 09:57:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-15 22:34
没必要。
如果你有IRC,可以计算垂直于IRC方向的所有振动模式对零点能、Gibbs自由能的贡献,不过对于一般 ...

谢谢回答 不打算做振动分析了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-16 09:59:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-16 03:28
一般量化研究里,非驻点的振动分析有意义的情况主要是变分过渡态理论研究中对过渡态周围的结构做振动分析获 ...

谢谢老师的解答,既然没必要就不做振动分析了,还可以省很多计算资源。
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