GaussView Linux上打不开chk文件，fchk中的cube也无法加载

nunup5 · 发表于 Post on 2015-10-30 16:42:23

在服务器上第一次安装Gaussian和Gaussview，然后就出现以下问题：打开chk文件时，提示cannot find file
打开fchk，upload cube时，提示The cube generator failed

Gaussian和Gaussview安装到同一目录下了，出现这种状况到底是什么原因呢？

各位大神帮帮忙！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-10-30 21:01:06

拿Windows版本的GV打开Linux Gaussian生成的chk就有这个问题。是不是用Linux GV去开的Windows下生成的Chk？（仅仅是排除一下）

anmin0127 · 发表于 Post on 2015-10-30 21:28:47

如果路径没有问题的话那就是文件版本不兼容或者你的计算结果本来就是不正确的

我本是个娃娃 · 发表于 Post on 2015-11-2 09:14:32

再也不用Gview看轨道了，直接上Multiwfn，相当快速，而且效果更好

nunup5 · 发表于 Post on 2015-11-2 09:15:57

liyuanhe211 发表于 2015-10-30 21:01
拿Windows版本的GV打开Linux Gaussian生成的chk就有这个问题。是不是用Linux GV去开的Windows下生成的Chk？ ...

是用Linux GV打开了另一个集群上面算好拷过来的chk，有可能是在文件传输过程中有损坏，或者是文件不兼容吧，一个是CentOS 6.4 一个是CentOS 7。

nunup5 · 发表于 Post on 2015-11-2 09:19:22

anmin0127 发表于 2015-10-30 21:28
如果路径没有问题的话那就是文件版本不兼容或者你的计算结果本来就是不正确的

用CentOS 7中的GV打开在CentOS 6.4上面算好的chk，可能是文件版本不兼容吧，或者文件传输中有损坏。反正全部在CentOS 7中计算和打开的文件没有问题。谢谢您的提示！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-11-2 10:34:49

nunup5 发表于 2015-11-2 09:15
是用Linux GV打开了另一个集群上面算好拷过来的chk，有可能是在文件传输过程中有损坏，或者是文件不兼容 ...

不清楚不同Linux上是否有不同。在计算所用机器上用formchk工具生成fch文件，拷到你想要的电脑上打开。

anmin0127 · 发表于 Post on 2015-11-2 15:27:49

nunup5 发表于 2015-11-2 09:19
用CentOS 7中的GV打开在CentOS 6.4上面算好的chk，可能是文件版本不兼容吧，或者文件传输中有损坏。反正 ...

不客气，互相学习，可以用gaussian转化为fchk试试

stecue · 发表于 Post on 2015-11-3 05:15:30

nunup5 发表于 2015-11-2 09:19
用CentOS 7中的GV打开在CentOS 6.4上面算好的chk，可能是文件版本不兼容吧，或者文件传输中有损坏。反正 ...

怀疑传输出错直接比较大小一般可以解决。或者用文件指纹
md5sum XXX.chk
如果两个系统中同一个文件的md5sum不一样则拷贝出错了。

stecue · 发表于 Post on 2015-11-3 05:16:26

我本是个娃娃发表于 2015-11-2 09:14
再也不用Gview看轨道了，直接上Multiwfn，相当快速，而且效果更好

或者用avogadro，可自动载入同样主文件名的.fchk文件。

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[Gaussian/gview] GaussView Linux上打不开chk文件，fchk中的cube也无法加载

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