Gromacs中如何构建菱形的盒子

ruanyang · 发表于 Post on 2015-11-9 21:36:28

请教一个问题，因为模拟工作的需要。我想在gromacs中构建一个菱形的盒子进行模拟。我知道editconf 命令可以指定盒子的形状，但是其选项中不存在菱形。只有菱形十二面体或者是八面体，我不太清楚如果指定 -bt 为菱形十二面体的话，那个-box 后面的x,y,z 以及角度的值如何确定。请社友帮忙解释一下！附上菱形的大致形状！

XYwinne · 发表于 Post on 2015-11-13 13:49:51

-bt triclinic -box 10 10 10 -angles 90 90 120
你是不是要用SiO2？

ruanyang · 发表于 Post on 2015-11-13 14:13:03

不是，谢谢您的回复。只是想试试菱形的盒子

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[GROMACS] Gromacs中如何构建菱形的盒子