计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9960|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 在计算分子电场下键离能的时候,在断开键分开算两边的时候,还要加电场吗

[复制链接 Copy URL]

233

帖子

0

威望

1317

eV
积分
1550

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 ddddnight 于 2021-1-30 17:31 编辑

在计算电场下分子的键离能,在对整体分子进行优化之后,取出优化后的分子,对键位两边进行优化和频率计算的的过程中,还需不需要加入电场。

1102

帖子

18

威望

6703

eV
积分
8165

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

2#
发表于 Post on 2021-1-30 17:36:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 冰释之川 于 2021-1-30 17:42 编辑

要加,而且注意要加nosymm 防止高斯对分子自动调整坐标方向。
其实如果只是理论计算的话,片段结构直接取自复合物,然后加电场算个单点就行了,也没必要优化片段结构,这时候计算键解离能时用电子能量即可。

当然如果你还想考察片段在复合物中结构相对于片段孤立结构的变形能的话,就要优化片段结构了。
Stand on the shoulders of giants

233

帖子

0

威望

1317

eV
积分
1550

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-30 17:42:35 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2021-1-30 17:36
要加,而且注意要加nosymm 防止高斯对分子自动调整坐标方向

但是在加入电场之后分子总体优化出来,键长是变长,键长变长键离能会变小,但是如果加入电场之后计算,键离能是变大的

1102

帖子

18

威望

6703

eV
积分
8165

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

4#
发表于 Post on 2021-1-30 17:49:22 | 只看该作者 Only view this author
ddddnight 发表于 2021-1-30 17:42
但是在加入电场之后分子总体优化出来,键长是变长,键长变长键离能会变小,但是如果加入电场之后计算,键 ...

解离能变大是(1)分子结构变化和(2)是否加电场共同作用导致的,你不能把它直接归结于键长变长(分子结构变化)头上
Stand on the shoulders of giants

233

帖子

0

威望

1317

eV
积分
1550

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-30 18:09:09 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2021-1-30 17:49
解离能变大是(1)分子结构变化和(2)是否加电场共同作用导致的,你不能把它直接归结于键长变长(分子结构变 ...

好的,谢谢你

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2021-1-30 19:50:17 | 只看该作者 Only view this author
没有“键离能”,只有键解离能

整体、裂解后的片段都需要在电场下做opt freq
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

233

帖子

0

威望

1317

eV
积分
1550

Level 5 (御坂)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-30 20:29:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-30 19:50
没有“键离能”,只有键解离能

整体、裂解后的片段都需要在电场下做opt freq

知道了,谢谢老师纠正

14

帖子

0

威望

255

eV
积分
269

Level 3 能力者

8#
发表于 Post on 2022-6-6 17:46:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-30 19:50
没有“键离能”,只有键解离能

整体、裂解后的片段都需要在电场下做opt freq

老师,那如果是算键能呢,整体和断裂后的片段需要在电场作用下不优化算单点吗,还是说不优化所以结构不变,加不加电场不影响

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2022-6-7 08:22:13 | 只看该作者 Only view this author
Kelly00 发表于 2022-6-6 17:46
老师,那如果是算键能呢,整体和断裂后的片段需要在电场作用下不优化算单点吗,还是说不优化所以结构不变 ...

直接算单点

电场影响电子结构,显然得加电场
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 07:21 , Processed in 0.199184 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list