cp2k跑AIMD怎么设置升温呢

qwe1832518773 · 发表于 Post on 2021-2-12 15:23:29

想跑一个反应，实验下是逐渐升高温度到2500度才能观察到反应发生（2h），想用AIMD简单的模拟一下。记得之前看到过论坛里sob老师给一个帖子回复说，如果一下子给很高的温度的话，随机生成的初速度不如逐渐升温得到的好（这个帖子一时半会搜不到了，但是应该是这个意思）
因此打算从300K开始逐渐升温至2500度，每一个温度停留1ps，这样该写什么指令呢，应该不能继续用NPT系综了吧，下面是我以前恒温AIMD任务的温度设置部分，需要怎么修改呢？

&MD
      ENSEMBLE NPT_I
      TEMPERATURE 300
      TIMESTEP 0.5
      STEPS 2000
         &BAROSTAT
            PRESSURE 1
            TEMPERATURE 300
         &END BAROSTAT
         &THERMOSTAT
         TYPE NOSE
         REGION GLOBAL
         &NOSE
            TIMECON 1000
            LENGTH 3
            MTS 2
         &END NOSE
      &END THERMOSTAT
&END MD

麻烦各位dalao帮我看看了，给您们拜年了，牛年大吉！！！

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-12 16:26:53

没法通过一个文件实现，需要靠批处理文件

初速度直接对应很高温度的话很容易崩

这和NPT完全没有矛盾之处。热浴建议改用CSVR，Nose-Hoover很不适合尚未达到平衡状态的模拟

qwe1832518773 · 发表于 Post on 2021-2-13 12:39:05

sobereva 发表于 2021-2-12 16:26
没法通过一个文件实现，需要靠批处理文件

初速度直接对应很高温度的话很容易崩

谢谢sob老师大过年的给我回复，我想知道比如一个任务，比如1ps内从0K升到300K，这样的升温改用什么指令呢？我网上搜了一下好像没有搜到相关的信息，应该不是直接写一个TEMPERATURE 300吧

啦啦黑还黑 · 发表于 Post on 2021-2-13 18:53:03

一个文件也能退火升温，改用NVE系综，别用0K作为初始问题，设置初始温度10 K，设置annealing 1.001 但是没有办法控制升温的时间1ps，这个要自己算一下大概跑多少步。

sobereva · 发表于 Post on 2021-2-14 20:15:07

NVE结合ANNEALING的退火方式相当于用最原始的速度调解法来变温，而且是每一步都这么调一次速度，这完全抑制了真实热浴下理应有的热涨落，人为因素过强。迫不得已可以用，但仅限用于变温过程的目的，跑特定温度下的动力学现象还是应当结合热浴。

“直接写一个TEMPERATURE 300”只是要求让温度平衡到300 K，并不体现“1ps”（如果额外指定/读取初速度，热浴的时间常数决定了从初始温度平衡到平均300K过程的快慢）。CP2K这方面做得不理想，应该增加一个像GROMACS的控制热浴的参考温度变化的选项。

nusiew · 发表于 Post on 2021-6-30 19:33:10

请问楼主解决这个问题了吗

star2128 · 发表于 Post on 2023-1-6 19:41:04

啦啦黑还黑发表于 2021-2-13 18:53
一个文件也能退火升温，改用NVE系综，别用0K作为初始问题，设置初始温度10 K，设置annealing 1.001 ...

请问NVE如何设置初始温度啊？只有一个TEMPERATURE不是目标温度么。

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