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[ORCA] ORCA做AIMD时莫名停滞

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3950X,模拟设定10000步,至今才2000多已经停滞2次了,现象是没有任何错误报告下,进程的cpu占用从100%降到1%并保持这个状态。

值得一提的,模拟相同分子不同温度的另一台2683v3没有这种错误,始终平稳运行。

两台OS都一样的。

哪位知道怎么解决?谢谢



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发表于 Post on 2021-2-27 10:51:26 | 只看该作者 Only view this author
这恐怕得去orca论坛问neese了,也许是什么bug

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发表于 Post on 2021-2-27 14:27:06 | 只看该作者 Only view this author
动力学过程中会产生一些.log,比如其中有记录SCF迭代过程等更细节信息的文件,看看里面的内容。看不出问题就只能去官方论坛问开发者了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2021-2-27 14:29:47 | 只看该作者 Only view this author
用的是什么版本的orca?旧版的orca跑AIMD会越跑越慢,后来4.1.0还是4.2.0修复了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2021-2-27 18:38:28 | 只看该作者 Only view this author
看看是不是用的openmpi3
换成2会改善
https://orcaforum.kofo.mpg.de/vi ... &p=24996#p24996

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发表于 Post on 2021-3-2 02:08:40 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-2-27 14:29
用的是什么版本的orca?旧版的orca跑AIMD会越跑越慢,后来4.1.0还是4.2.0修复了

越跑越慢的问题我发现在4.2.1依然有,所以每次我都每次跑<=两千步,长轨迹分多段跑
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发表于 Post on 2021-3-2 03:46:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-2 02:08
越跑越慢的问题我发现在4.2.1依然有,所以每次我都每次跑

是吗?我好像4.2.1没有遇到这种问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2021-3-3 01:24:34 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-2 03:46
是吗?我好像4.2.1没有遇到这种问题

双路Intel E5-2696v3,256GB内存,CentOS 7, ORCA 4.2.1,OpenMPI 3.1.4。跑多个体系都有类似问题


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