gmx clustsize命令的使用请教

芝士栗子小甜饼 · 发表于 Post on 2021-3-3 09:26:07

各位老师好，我想请问一下能否gmx clustsize实现这样的目的：当不同分子中氧原子之间的距离小于3.5埃时，就把它划分为一个团簇？具体的命令该如何实现呢？

苏玖染 · 发表于 Post on 2021-3-3 20:58:27

gmx clustsize不能区分原子，除非你的一个分子中只有一个氧原子

芝士栗子小甜饼 · 发表于 Post on 2021-3-4 08:52:06

苏玖染发表于 2021-3-3 20:58
gmx clustsize不能区分原子，除非你的一个分子中只有一个氧原子

好的谢谢回复

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] gmx clustsize命令的使用请教