求助，跑完的轨迹可以更改轨迹中分子的残基名称么？

rice · 发表于 Post on 2021-3-30 10:22:16

跑了好几个体系的轨迹出来，发现之前itp文件设置时，所有分子的残基名称都设成一样了，麻烦问下大家，有不重新再跑一边动力学就能更改轨迹残基号的方法么？

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-31 12:55:11

轨迹并不体现残基名，同时产生的gro文件里才体现

rice · 发表于 Post on 2021-4-1 13:01:49

sobereva 发表于 2021-3-31 12:55
轨迹并不体现残基名，同时产生的gro文件里才体现

谢谢sob老师，如果要使用gmx msd或gmx hbond 命令，是否只能通过加入索引文件来实现呢？

sobereva · 发表于 Post on 2021-4-1 14:25:29

rice 发表于 2021-4-1 13:01
谢谢sob老师，如果要使用gmx msd或gmx hbond 命令，是否只能通过加入索引文件来实现呢？

这个问题和最开始的问题没看出有任何直接联系，我也不清楚你的目的是什么

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[GROMACS] 求助，跑完的轨迹可以更改轨迹中分子的残基名称么？