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[GROMACS] 求助:GROMACS中使用energy提取的Surface tension需要除以实际的界面个数吗?

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本帖最后由 Annie1024 于 2021-4-7 15:50 编辑

最近在学习GROMACS模拟膜蛋白体系,请教...

我在用gromacs进行膜蛋白体系的模拟,想要模拟机械力刺激双分子层的情况,压力耦合处使用surface-tension,动力学平衡和产出之后,使用gmx energy提取第43项,#Surf*SurfTen..项

由于看到手册中设置的ref_p 是参考surface tension 乘以界面的个数,因此想问一下,使用gmx energy提取第43项除以界面个数,2,是体系的surface tension吗

非常感谢大家!







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