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[任务提交/队列管理] 请问怎样提交脚本作业给超算

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本帖最后由 zhi2679889405 于 2021-5-10 17:36 编辑

利用此脚本提交作业
#BSUB -q normal
#BSUB -n 40
#BSUB -R "span[ptile=20]"
#BSUB -cwd .
#BSUB -e %J.err
#BSUB -o %J.out
export g09root=/opt/
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
export PATH=$g09root/g09:$PATH
export GAUSS_SCRDIR=/tmp
export GAUSS_LFLAGS="-opt 'Tsnet.Node.lindarsharg:ssh'"
#list host name
export GAUSS_WDEF="$(cat $LSB_DJOB_HOSTFILE|sort|uniq|awk '{ printf("%s,",$1) }' | sed 's/,$//')"
#specify SMP core number
export GAUSS_PDEF="20"
g09 < Au20tcnq-edge.com > Au20tcnq-edge.log

#BSUB -q default 队列
#BSUB -n 40 : 总核数
#BSUB -R "span[ptile=20]" : 每个节点核数
#BSUB -e %J.err : 标准错误流重定向文件,%J表示作业号
#BSUB -o %J.out : 标准输出重定向文件,%J表示作业号
export GAUSS_PDEF="20"    : 每个节点核数,需span的值一致

Au20tcnq-edge.com : 高斯输入文件,只需要制定%check %mem, 不需要指定nprocs等

作业提交方式:
bsub < g90.sh

新手第一次使用,麻烦各位前辈了

本版积分规则 Credits rule

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