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[新手求助] 计算激发态优化结束结构有个碳氢键断裂,为什么?

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本帖最后由 大肥猫 于 2021-4-30 14:44 编辑

在对附件结构进行激发态优化,计算激发能时,激发态优化正常结束,但是得到的结构其中一个碳氢键断裂了(见下图),请问是什么原因呢?或者说明了什么呢?说明在激发态这个断裂的质子比较活泼吗?
输入文件如下:

%nprocshared=14
%mem=15GB
%chk=YHWA-24-search-1.1.chk
# opt pbe1pbe/6-311g(d) TD scrf=(smd,solvent=acetonitrile)

D:\EtOAc-calculate\YHWA-24\cluster.xyz

0 1
C                  2.85016500    1.01953700    0.36661200
C                  3.06315000   -0.22483500   -0.10265200
C                  1.92048800   -1.18136800   -0.26875300
C                  0.54587200   -0.71536400    0.05188500
C                  0.33669900    0.54438800    0.49528000
C                  1.51393700    1.45453600    0.73325500
O                  1.34308800    2.55246900    1.24333300
O                  2.14330900   -2.30656100   -0.66637400
C                 -0.53921600   -1.76495400   -0.14274400
C                 -1.68496900   -1.28158800   -0.97303600
C                 -2.81627200   -1.33555200   -0.27482100
C                 -4.09455500   -0.63385200   -0.55907000
C                 -4.01705300    0.78046000    0.07844800
C                 -1.00407000    1.14712400    0.83460300
C                 -1.71203700    1.81874400   -0.33014500
C                 -3.01638200    1.66416400   -0.59933800
C                 -0.87218800    2.74679500   -1.15805100
C                 -2.53537900   -1.96714100    1.05362300
O                 -1.12199800   -2.12819500    1.11305700
O                  4.22159300   -0.75929400   -0.45101600
C                  5.38273100    0.05588700   -0.32785300
H                  3.64668400    1.73624100    0.52731700
H                 -0.05613300   -2.65150100   -0.56777900
H                 -1.55446700   -0.86601900   -1.96529300
H                 -4.26417800   -0.54101500   -1.63588600
H                 -4.94955500   -1.17005400   -0.13349500
H                 -3.80607700    0.67504400    1.14731500
H                 -5.00786900    1.24086500    0.00518900
H                 -1.64057700    0.39788000    1.29775600
H                 -0.80853200    1.91978800    1.58693400
H                 -3.40287600    2.22149700   -1.45391300
H                 -0.04545200    2.21367700   -1.64389400
H                 -1.46409600    3.22885300   -1.93946400
H                 -0.41418900    3.52693100   -0.54048800
H                 -3.02530100   -2.94729100    1.15027900
H                 -2.87176300   -1.35161400    1.89982200
H                  5.53610200    0.35441200    0.71279100
H                  6.21430200   -0.56066600   -0.66208100
H                  5.30050400    0.94372500   -0.96056700




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发表于 Post on 2021-4-30 16:15:29 | 只看该作者 Only view this author
仔细读这篇文章 http://sobereva.com/414
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-4-30 20:51:47 | 只看该作者 Only view this author
可以和相同泛函和基组下优化的基态的键长对比,如果有可查觉的增长,暗示激发态的时候这个键被削弱了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-30 21:16:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-30 20:51
可以和相同泛函和基组下优化的基态的键长对比,如果有可查觉的增长,暗示激发态的时候这个键被削弱了

老师,我看了,在基态优化后键长为1.09544,激发态同等计算水平键长为1.13706,是否说明在激发态该位点键长弱化,氢质子反应性更活泼了呢?在实验中,该位点的质子发生了转移。

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发表于 Post on 2021-5-1 22:48:54 | 只看该作者 Only view this author
大肥猫 发表于 2021-4-30 21:16
老师,我看了,在基态优化后键长为1.09544,激发态同等计算水平键长为1.13706,是否说明在激发态该位点键 ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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