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[xtb] GFN1-xTB不支持含卤素原子的PBC计算么

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xTB 6.3.0版本就声称支持了GFN1的PBC计算
然而我在6.4.0版本(conda 安装)下对用这个分子构建的周期性原胞用 --gfn 1 计算就报如下错误
  1. ########################################################################
  2. [ERROR] Program stopped due to fatal error
  3. -4- Single point calculation terminated
  4. -3- xtb_calculator_singlepoint: Electronic structure method terminated
  5. -2- scf: Halogen bond correction not available with PBC
  6. -1- restart_readRestart: Version number missmatch in restart file.
  7. ########################################################################
复制代码
但是 --gfn 0 就不会报错,用其它简单分子构建的原胞 --gfn 1 也不报错。
是因为Halogen bond correction的原因么,我看了xtb-docs跟github的releases似乎都没提这个事。
这个分子中都还算是比较常见的主族元素,我不知道是因为这种体系GFN1-xTB还不支持,还是我软件没用对的缘故...


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发表于 Post on 2021-5-11 05:53:48 | 只看该作者 Only view this author
建议拿CP2K来跑GFN1-xTB
如果已经有了cif文件,用Multiwfn敲几下键盘就能得到做GFN1-xTB各种任务的输入文件,十分方便
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html
相比CP2K来说,xtb自己的PBC功能太弱了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-11 21:25:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-11 05:53
建议拿CP2K来跑GFN1-xTB
如果已经有了cif文件,用Multiwfn敲几下键盘就能得到做GFN1-xTB各种任务的输入文 ...

谢谢社长,今天装了CP2K,的确可以跑完GFN1-xTB下的PBC结构优化,且优化完的结构还算合理。输出文件显示整个过程中的 Correction for halogen bonding 的能量为0 。

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