计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5228|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 小基组优化加大基组计算单点的问题

[复制链接 Copy URL]

65

帖子

0

威望

397

eV
积分
462

Level 3 能力者

通过大基组加隐式溶剂计算单点能再加上小基组的校正,得到的最终结果,初始反应物的能量高于过渡态的能量,能垒在小基组计算时比较小,也就是说没有能垒了,这种情况是为什么,这个结果可信吗,可以用吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-9-6 16:19:43 | 只看该作者 Only view this author
把问题表述清楚,“小基组的校正”都不说具体是什么,得到什么结果
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

65

帖子

0

威望

397

eV
积分
462

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-6 21:31:11 | 只看该作者 Only view this author
问题没有讲清楚,我用的是小基组优化和找过渡态(m062x/def2svp)+大基组吉布斯自由能热校正(m062x/def2tzvpp), 但过渡态的反应物一端能量高于过渡态了,不知道怎么办

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2021-9-6 21:55:42 | 只看该作者 Only view this author
振动分析必须和优化同一级别,这是最基本常识。你的做法毫无意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

65

帖子

0

威望

397

eV
积分
462

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-7 08:36:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jw227 于 2021-9-7 08:53 编辑

老师,那文献所说“The reported free energies in this work were based on the electronic energy of single point calculations, including the Gibbs free energy thermal correction obtained from vibrational analysis in gas phase." "To refine the calculated energy, single  point calculation with larger basis set were then done based on these optimized structures", 不是这样算的? 我 搞错了? 抱歉,我写错了,是大基组单点能量加小基组吉布斯自由能热校正,但计算完后,过渡态能量高于反应初始态(IRC获得)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2021-9-8 05:18:23 | 只看该作者 Only view this author
jw227 发表于 2021-9-7 08:36
老师,那文献所说“The reported free energies in this work were based on the electronic energy of sin ...

IRC根本就没法给你跑到精确的反应物结构,必须进行优化,这里明确说了
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html

如果已经优化了,公社论坛首页google框搜 “过渡态 能量 比反应物高”。老生常谈的问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

65

帖子

0

威望

397

eV
积分
462

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-8 09:52:57 | 只看该作者 Only view this author
优化了的,谢谢老师,我先查一下

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 07:38 , Processed in 0.158161 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list