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[Lammps] Lammps使用fix clovars做伞状抽样报错Segmentation fault

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大家好,我初学习使用Lammps做伞状抽样,使用的是Fix Clovars命令实现开始阶段的pull动力学,动力学过程可以正常结束,但在slurm.out中看到一些报错记录(详见附件),Segmentation fault看起来不像是由于输入文件错误导致的报错,感到不解,请教下有经验的老师,望各位不吝赐教!

slurm_err.png (115.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

slurm_err.png

us.colvars.traj

56.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

log.us

273.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

slurm-4994287.out

273.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

configuration

537 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 8

in.complex

756 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 12

us.zip

29.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 11

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-8 15:50:21 | 只看该作者 Only view this author
同时贴上clovars的输入文件麻烦路过的大佬帮忙看看是否有问题

us.png (40.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

us.png

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发表于 Post on 2021-11-12 11:02:34 | 只看该作者 Only view this author
我也在学lammps+colvars 利用US计算PMF 想知道有没有详细的教程。。。。

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发表于 Post on 2022-8-23 10:19:08 | 只看该作者 Only view this author
楼主解决这个问题了吗?我现在做LAMMPS切削也遇到了segmentation fault。。。。

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