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[GROMACS] GROMACS中mdp文件中deform关键词意义

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GROMACS中mdp文件的deform关键词的后三位分别表示哪几个方向的剪切呢

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发表于 Post on 2022-2-22 21:01:18 | 只看该作者 Only view this author
手册里都写明了
诸如c(y)代表盒子c矢量的y分量

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-23 10:27:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 立正 于 2022-2-23 10:29 编辑
sobereva 发表于 2022-2-22 21:01
手册里都写明了
诸如c(y)代表盒子c矢量的y分量

好的 谢谢社长的回复。如果说我用 “0 0 0 1 0 0” 、“0 0 0 0 2 0”、“0 0 0 0 0 3” ,这三种情况分别取剪切的话,应该分别提取energy中“Pres-&&” ,中哪几个来分析呢

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发表于 Post on 2022-2-23 18:41:44 | 只看该作者 Only view this author
立正 发表于 2022-2-23 10:27
好的 谢谢社长的回复。如果说我用 “0 0 0 1 0 0” 、“0 0 0 0 2 0”、“0 0 0 0 0 3” ,这三种情况分 ...

我不知道你想分析什么
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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