计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4399|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 多中心键级这一描述符应用的一些疑问

[复制链接 Copy URL]

67

帖子

0

威望

369

eV
积分
436

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 radical 于 2022-4-19 14:36 编辑

h4-c2v.rar (556.84 KB, 下载次数 Times of downloads: 5) 1.对于下图H4-四氮杂卟啉(加氢,并不是质子化,电荷与多重度:0 1,没有虚频),AICD的感应电流(磁场从屏幕里朝向屏幕外)和NICS(1)ZZ(数值为26.07)都显示出了明显的反芳香性,但通过考察它的MCI-pi(因为是非平面体系,已用multiwfn对占据轨道定域化),发现内环0.343,外环0.559,我之后,又单纯只算了MCI,,内环0.447,外环0.559,无论是哪个环,都应是是20个pi电子(4n),MCI的数值不应该这么大,对于类似的体系H0-四氮杂卟啉(去2个氢),它的AICD和NICS都显示它是非芳香性的,从MCI-pi(内环0.058,外环0.083)上看也是吻合的。
H4-四氮杂卟啉


H0-四氮杂卟啉






2.对四氮杂卟啉质子化(H3P1,电荷 多重度: +1 1,没有虚频),同样是非平面体系,对轨道定域化处理后,MCI-PI值为负值(-0.428),MCi为0.538,请问负值是什么原因,即便是反芳香性不也应该是接近0吗

fchk文件不知道为啥上传不了。。。显示过大


h3p1.rar

872.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2022-4-19 13:50:14 | 只看该作者 Only view this author
fch压缩后上传,看首页的提醒

67

帖子

0

威望

369

eV
积分
436

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-19 14:27:31 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2022-4-19 13:50
fch压缩后上传,看首页的提醒

好的,fch文件已上传

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2022-4-20 02:53:17 | 只看该作者 Only view this author
对这些体系没必要专门计算pi电子,本身sigma也不会对离域有贡献
对于原子数非常多的环,归一化的多中心键级的数值区分度不大。这种时候适合用原始的多中心键级对比芳香性的相对高低,也可以用一个芳香性已知较高的环的值作为参照来判断其它的环。

例如对于卟啉,在B3LYP/6-31G*级别下,我图中所示的路径的多中心键级是0.0000568579


而你的体系,按照下图路径计算多中心键级(序号输入15,13,22,3,1,2,4,24,8,10,9,23,19,17,16,18,21,14),数值为0.0000076732,相比之下可知芳香性极低,要么非芳香性要么反芳香性

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

67

帖子

0

威望

369

eV
积分
436

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-20 09:32:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 radical 于 2022-4-20 10:29 编辑
sobereva 发表于 2022-4-20 02:53
对这些体系没必要专门计算pi电子,本身sigma也不会对离域有贡献
对于原子数非常多的环,归一化的多中心键 ...

谢谢老师,那对于原子数不同的共轭路径,这个时候用原始的MCI数据去比较不同环的芳香性还有意义吗,我用AV1245去比较的不同环的芳香性得到的差值还是比较明显的,但问题是但对于个别物质,比如H4-四氮杂卟啉的芳香性描述与AICD和NICS并不是很符合


6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2022-4-21 06:34:26 | 只看该作者 Only view this author
radical 发表于 2022-4-20 09:32
谢谢老师,那对于原子数不同的共轭路径,这个时候用原始的MCI数据去比较不同环的芳香性还有意义吗,我用A ...

原始的MCI不可能对不同原子数的环之间进行对比
对于原子数很多的路径,AV1245比归一化的MCI在数值上对芳香性强弱的区分度往往更高一些
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 18:52 , Processed in 0.184842 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list