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[综合交流] 请求有关于分子动力学和分子力学,以及两者的区别的资料

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楼主
请求有关于分子动力学和分子力学,以及两者的区别的资料,或者请大家详细解释一下,谢谢。
一直以来都是按照自己理解,但是发现还是有不对的地方。。。希望大家能帮助一下,谢谢

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发表于 Post on 2016-3-27 22:07:12 | 只看该作者 Only view this author
Computational Chemistry

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发表于 Post on 2016-3-28 00:25:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-3-28 23:00 编辑

个人理解:

这俩不是一个层面上的东西。

分子力学(MM)是一种获得势能面的方法,即用于给出每一给定构象的性质,其(区别于量子力学)只“看到”核而不看电子,与量子力学方法如WFT(Wave function theory)、DFT、semi-empirical并列。

分子动力学(MD)属于一种模拟方法,是获得大量分子的集合性质的一种方法;其与蒙特卡洛方法等模拟方法并列。

分子动力学方法可以使用任何势能面,可以用分子力学的势能面,也可以用量子的势能面。用从头算获得的势能面跑的分子动力学称AIMD(ab initio MD)

相关内容在大多数分子模拟的课本上都有,如 Leach 的 Molecular Modelling

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发表于 Post on 2016-3-28 12:50:07 | 只看该作者 Only view this author
同意楼上观点。
啰嗦一句:
因为MD需要计算大量构型,所以以前一般都是使用MM计算能量。这也是为什么这两个概念常常一起出现的原因吧。
后来计算机水平提高了,也可以用高精度的方法计算不同构型的能量了,就是所谓AIMD了吧。
华北电力大学数理学院,理论与计算化学,团簇、表面的结构与反应机理。(招第一性原理计算,量子化学计算方向的教师、硕士/博士研究生)

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