gmx_MMPBSA如何应用于charmm力场计算pb

tanyingjia · 发表于 Post on 2022-5-17 16:24:48

最近做的蛋白小分子模拟，需要做一下结合自由能。所以我使用了sob老师推荐的gmx_MMPBSA计算，看到它们是支持Charmm力场，但是在教程中他们的输入文件力场是forcefields="oldff/leaprc.ff99SB,leaprc.gaff" 然后我的问题是，如何使用charmm力场计算完成的一系列文件来运行gmx_MMPBSA。有没有大佬可以分享一下经验呢

CCCCCC921 · 发表于 Post on 2023-9-22 15:01:12

请问这个问题您解决了吗，可以分享一下方法吗

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[GROMACS] gmx_MMPBSA如何应用于charmm力场计算pb

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