计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3003|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] 请问在计算过渡态时,如何查看受力情况?

[复制链接 Copy URL]

30

帖子

0

威望

319

eV
积分
349

Level 3 能力者

如题,计算过渡态迟迟不收敛,我想查看一下原子受力情况

46

帖子

1

威望

613

eV
积分
679

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2022-6-9 08:41:16 | 只看该作者 Only view this author
可以根据vtst脚本中的vef.pl和李湃的网站(http://home.ustc.edu.cn/~lipai/index.html)上的converg.sh进行判断,结构优化和过渡态都可以使用。加入到bashrc中就可以了

vef.pl

1.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 24

converg.sh

1.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 21

30

帖子

0

威望

319

eV
积分
349

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-9 09:02:59 | 只看该作者 Only view this author
QH1995 发表于 2022-6-9 08:41
可以根据vtst脚本中的vef.pl和李湃的网站(http://home.ustc.edu.cn/~lipai/index.html)上的converg.sh进 ...

好的,非常感谢

52

帖子

0

威望

257

eV
积分
309

Level 3 能力者

4#
发表于 Post on 2022-6-9 22:51:28 | 只看该作者 Only view this author
QH1995 发表于 2022-6-9 08:41
可以根据vtst脚本中的vef.pl和李湃的网站(http://home.ustc.edu.cn/~lipai/index.html)上的converg.sh进 ...

借楼请问一下前辈,计算某原子在特定表面的扩散能垒时应该如何确定初末态呢?我初步的想法是从一个全局最小点到相邻的另一个全局最小点,穷举可能的路径并计算,但是看到文献里同一个表面的计算路径各不相同,而且结果差距很大,不知道有没有什么经验可以指导?

46

帖子

1

威望

613

eV
积分
679

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2022-6-10 13:01:49 | 只看该作者 Only view this author
Daisy_zju 发表于 2022-6-9 22:51
借楼请问一下前辈,计算某原子在特定表面的扩散能垒时应该如何确定初末态呢?我初步的想法是从一个全局最 ...

就我的了解来说(可能比较局限),初末态的结构肯定是要全局的最小点,但是穷举法确实很费时间而且还不一定能穷举完。像高斯计算小分子结构(非晶胞结构)可以势能面扫描,这样是可以筛选出最小点的。但是VASP计算晶体类型的表面结构需要考虑的就很多了,比如晶面切面,晶面位点,吸附分子的构型(比如CO的O-down或C-down),穷举法不太现实。所以我一般是看文献里提供的模型,先总结出几个比较适合自己的初末态结构,然后计算反应势垒,选择能垒比较低的路径作为研究对象,然后后续的工作都是在类似的基础上开展的。另外,复旦刘智攀老师开发的LASP的SSW算法理论上也是可以算出来整个势能面上的最小点的,有兴趣可以了解下

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
Daisy_zju + 2 谢谢分享

查看全部评分 View all ratings

52

帖子

0

威望

257

eV
积分
309

Level 3 能力者

6#
发表于 Post on 2022-6-10 15:46:37 | 只看该作者 Only view this author
QH1995 发表于 2022-6-10 13:01
就我的了解来说(可能比较局限),初末态的结构肯定是要全局的最小点,但是穷举法确实很费时间而且还不一 ...

感谢前辈的耐心回答!我现在有个新的想法,因为NEB的路径随机性太强了,不知道用AIMD计算再比对扩散系数合理嘛?还是说原子在固体表面的扩散能垒不能用AIMD计算?(因为无法保证原子一直在表面?)

46

帖子

1

威望

613

eV
积分
679

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2022-6-10 19:32:48 | 只看该作者 Only view this author
Daisy_zju 发表于 2022-6-10 15:46
感谢前辈的耐心回答!我现在有个新的想法,因为NEB的路径随机性太强了,不知道用AIMD计算再比对扩散系数 ...

我目前的研究还不涉及AIMD的计算,所以这个我也不太清楚哈

52

帖子

0

威望

257

eV
积分
309

Level 3 能力者

8#
发表于 Post on 2022-6-10 20:20:57 | 只看该作者 Only view this author
QH1995 发表于 2022-6-10 19:32
我目前的研究还不涉及AIMD的计算,所以这个我也不太清楚哈

好的好的,谢谢前辈的指导!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 07:21 , Processed in 0.169940 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list