求助CatMap学习问题

不明嚼栗子

各位老师同学，我照着CatMap网站 https://catmap.readthedocs.io/en/latest/tutorials/refining_a_microkinetic_model.html 上教程操作的时候，出现如下图的警告，我的数据和代码完全是从网站上复制过来的，没有动过，最后得到的图也和教程中给出的不大相同，请问大家这是什么原因啊_(:з」∠)_谢谢大家了！

我静静等待

你可以对比一下作者github上的教程代码，两者可能有所区别 https://github.com/SUNCAT-Center/catmap

是小智哎

请问你这个问题解决了嘛，我也遇到了这个问题

123wo

不要紧，兄弟，你把原始数据导出来，自己用origin去画图。这个实际还是正常收敛的对吧，结果是对的，就是画图画的不好。python output.py production_rate

123wo

我认为还有一种可能是这些地方不收敛，不管怎么说先把原始数据导出来自己作图看看吧

123wo

我当时是安装的catmap 0.3.0 版本的python用的是python2.7.18版本，这个安装出来可能会好用的多。比0.3.1和python3,多尝试吧

123wo

补充：graphviz-2.46.1 ，ase-3.16.0 ，numpy-1.11.1，scipy-1.2.3 ，matplotlib-2.1.1

2572094680

求助，怎么把原始数据导出来啊

哈库那摩塔塔

2572094680 发表于 2023-12-19 15:38
求助，怎么把原始数据导出来啊

https://catmap.readthedocs.io/en ... matting_output.html

CHLllooll

哈库那摩塔塔 发表于 2024-4-29 16:13
https://catmap.readthedocs.io/en/latest/topics/accessing_reformatting_output.html

请问前辈把数据导出来之后，origin里边画图，那个颜色要选什么样的才能和catmap输出的颜色差不多呢

angelsu

github上有对这个问题的讨论，之前试了可以解决

https://github.com/SUNCAT-Center/catmap/issues/137

CHLllooll

123wo 发表于 2023-12-8 11:04
补充：graphviz-2.46.1 ，ase-3.16.0 ，numpy-1.11.1，scipy-1.2.3 ，matplotlib-2.1.1

您好，请问把原始数据导出来之后在origin里边选择什么样的颜色才能和这个原始输出的色号类似呢

123wo

CHLllooll 发表于 2024-7-16 10:34
您好，请问把原始数据导出来之后在origin里边选择什么样的颜色才能和这个原始输出的色号类似呢

我都是不和catmap的类似的，感觉比较暗淡

CHLllooll

123wo 发表于 2024-7-16 19:41
我都是不和catmap的类似的，感觉比较暗淡

哦哦好的好的，我之前在一些文章里看过用导出的数据自己画图的，那些颜色和catmap差的挺大而且感觉不太好看；您知道像这类文章里他们那些活性图是咋画的吗？
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/ta/d4ta00710g
这是文章链接，在回复里好像发不了图片，还望见谅

123wo

CHLllooll 发表于 2024-7-16 22:21
哦哦好的好的，我之前在一些文章里看过用导出的数据自己画图的，那些颜色和catmap差的挺大而且感觉不太好 ...

我有一个配色方案文件和它差不读，稍等哈