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[综合交流] 如何把实验中的恒电位转化为Gaussian里的电场

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楼主
各位老师同学们好,我是还没入门的小白,请教各位问题,希望获得帮助。
这个课题需要计算团簇在一个恒电位下的一系列情况。之前查到是用field=read这样的加外场的指令来实现。但是目前已知的信息只有-500mv的恒电位,这样的如何量化为电场(a.u.)的大小呢?
用简单的公式去进行计算不太现实,团簇会直接接触到电极表面,感觉如果直接按照电极之间是匀强电场来处理的话误差会很大。

这个问题可能对于有经验的老师或同学比较简单,但是我确实不知道该如何处理。

谢谢

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发表于 Post on 2022-6-21 21:28:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2022-6-21 14:30 编辑

你这个计算应该是电解过程,和外加电场计算完全是不一样的。
高斯里field=read指的是在绝缘介质里,加一个电场,让你的分子被这个电场极化,但是不得失电子;而你的体系应该是允许分子得失电子的,与此同时这个电位导致的电场非常小,几乎没有化学效应,所以实验上观察到的外加电位的效应应该都是因为得失电子导致的。这种情况下应该这样做:(1)用https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.6b00252的方法计算这个体系的各级氧化还原电势;(2)比较计算的氧化还原电势和实验电位,判断分子在实验条件下所处的氧化态;(3)按照那个氧化态做常规计算就行了,不需要加电场。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-22 09:46:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-21 21:28
你这个计算应该是电解过程,和外加电场计算完全是不一样的。
高斯里field=read指的是在绝缘介质里,加一个 ...

谢谢老师,这个团簇是作为催化剂使用的,确实是存在这得失电子的情况,甚至配体有可能脱落。
这是一个比较大的Au团簇,有450个原子,请问这样的体系是不是不太适合用Gaussian呢,谢谢。

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发表于 Post on 2022-6-22 14:44:24 | 只看该作者 Only view this author
www1 发表于 2022-6-22 02:46
谢谢老师,这个团簇是作为催化剂使用的,确实是存在这得失电子的情况,甚至配体有可能脱落。
这是一个比 ...

这个太大了,不仅高斯很难算动,其他软件也都算不太动,除非用半经验方法。建议把体系截得小一些再算,或者用ONIOM算,内层用DFT,外层用xTB。
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-22 15:38:12 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-22 14:44
这个太大了,不仅高斯很难算动,其他软件也都算不太动,除非用半经验方法。建议把体系截得小一些再算,或 ...

好的,谢谢老师。

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