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[CP2K] 求助:CP2K晶胞优化报错

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本帖最后由 wangyueda 于 2022-6-22 18:41 编辑

请问下各位老师,我用CP2K优化Cu单胞时报错,报错信息及输入文件如下:

cp2k.out:
  1. *******************************************************************************
  2. *   ___                                                                       *
  3. *  /   \                                                                      *
  4. * [ABORT]                                                                     *
  5. *  \___/    found unexpected extra argument BETA at , File: 'cp2k.inp', Line: *
  6. *    |                         44, Column: 2, Chunk: <0.1>                    *
  7. *  O/|                                                                        *
  8. * /| |                                                                        *
  9. * / \                                               input/input_parsing.F:629 *
  10. *******************************************************************************


  11. ===== Routine Calling Stack =====

  12.             7 val_create_parsing
  13.             6 section_vals_parse
  14.             5 section_vals_parse
  15.             4 section_vals_parse
  16.             3 section_vals_parse
  17.             2 section_vals_parse
  18.             1 read_input
复制代码



cp2k.inp:

  1. DATAPATH /home/gengzi/install-packages/cp2k-9.1/data

  2. #The cp2k inp is consist of SECTIONs and KEYWORDs
  3. #The SECTION is green (pink) with '&' ahead
  4. #The KEYWORD is yellow without '&'
  5. #The red and black words the parameters matching with the KEYWORD
  6. #The writing order : SECTION => KEYSORDS => SUBSECTION

  7. #######################  1. GLOBAL SECTION   ########################
  8. #This section defines the calculation type
  9. &GLOBAL
  10.    PROJECT cp2k
  11.    #  RUN_TYPE GEO_OPT #the lattice constant unchanged
  12.    #  RUN_TYPE ENERGY  #single point calculation
  13.    #  RUN_TYPE MD      # MD
  14.    RUN_TYPE CELL_OPT # the lattice constant changed
  15.    PRINT_LEVEL LOW
  16. &END GLOBAL
  17. #######################  END GLOBAL SECTION  ########################

  18. #######################  2. FORCE_EVAL SECTION  #####################
  19. #This section defines the contents for electron step
  20. &FORCE_EVAL
  21.    STRESS_TENSOR ANALYTICAL
  22.    METHOD Quickstep

  23.    ###################   2.1 DFT SECTION  ###################
  24.    &DFT
  25.       BASIS_SET_FILE_NAME ${DATAPATH}/BASIS_MOLOPT
  26.       POTENTIAL_FILE_NAME ${DATAPATH}/GTH_POTENTIALS
  27.       WFN_RESTART_FILE_NAME ./cp2k-RESTART.wfn
  28.       UKS T

  29.       ###############    2.1.1 QS SECTION  #################
  30.       &QS
  31.          EPS_DEFAULT 1.0E-12
  32.          WF_INTERPOLATION ASPC
  33.          EXTRAPOLATION_ORDER 3
  34.       &END QS

  35.       ###############    2.1.2 MGRID SECTION  #############
  36.       &MGRID
  37.          CUTOFF 400 #unit Rydberg
  38.          NGRIDS 4
  39.          REL_CUTOFF 60
  40.       &END MGRID

  41.       ###############    2.1.3 XC SECTION  ###############
  42.       &XC
  43.          &XC_FUNCTIONAL PBE
  44.          &END XC_FUNCTIONAL
  45.       &END XC

  46.       #################  2.1.4 SCF SECTION  ##############
  47.       &SCF
  48.          SCF_GUESS RESTART
  49.          EPS_SCF 1.0E-6
  50.          MAX_SCF 500
  51.          ADDED_MOS 500
  52.          CHOLESKY INVERSE

  53.          &DIAGONALIZATION
  54.             ALGORITHM STANDARD
  55.             EPS_ADAPT 0.01
  56.          &END DIAGONALIZATION
  57.                                     
  58.          &SMEAR ON
  59.             METHOD FERMI_DIRAC
  60.             ELECTRONIC_TEMPERATURE [K] 300
  61.          &END SMEAR

  62.          &MIXING
  63.             METHOD BROYDEN_MIXING
  64.             ALPHA 0.1 BETA 1.5
  65.             NBROYDEN 8
  66.          &END MIXING

  67.          &PRINT
  68.             &RESTART OFF
  69.             &END RESTART
  70.          &END PRINT
  71.       &END SCF

  72.       &KPOINTS
  73.          SCHEME MONKHORST-PACK 3 3 3
  74.       &END KPOINTS
  75.    &END DFT   
  76.    ###################   END DFT SECTION  ###################

  77.    ###################   2.2 SUBSYS SECTION  ################
  78.    #This section mainly contains the CELL ,TOPOLOGY (or COORD) and KIND sections

  79.    #the CELL section contains the basic cell info: 1. lattice constant 2. the angle between lattice
  80.    #the TOPOLOGY (COORD) section specified the structral models. COORD for calculation that need to fixed atoms
  81.    #the KIND section point out the specified the BASIS and POTENTIAL for each elements

  82.    &SUBSYS
  83.       #################  2.2.1 CELL SECTION  ##############
  84.       &CELL
  85.          ABC 3.6147 3.6147 3.6147
  86.          ALPHA_BETA_GAMMA 90 90 90
  87.       &END CELL

  88.       #################  2.2.2 TOPOLOGY(COORD) SECTION  ##############
  89.       #usage: no atoms need to be fixed
  90.        &TOPOLOGY
  91.          COORD_FILE_NAME Cu.cif
  92.          COORD_FILE_FORMAT CIF
  93.        &END TOPOLOGY
  94.       
  95.       ##usage: some atoms need to be fixed
  96.       ##the fixed atoms list is writed in MOTION=>CONSTRAINT

  97.       #################  2.2.3 KIND SECTION  ##################
  98.       &KIND C
  99.          ELEMENT C     
  100.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  101.          POTENTIAL GTH-PBE-q4
  102.       &END KIND

  103.       &KIND H
  104.          ELEMENT H
  105.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  106.          POTENTIAL GTH-PBE-q1
  107.          MASS 2.014
  108.       &END KIND

  109.       &KIND O
  110.          ELEMENT O
  111.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  112.          POTENTIAL GTH-PBE-q6
  113.       &END KIND

  114.       &KIND F
  115.          ELEMENT F
  116.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  117.          POTENTIAL GTH-PBE-q7
  118.       &END KIND

  119.       &KIND Cu
  120.          ELEMENT Cu
  121.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  122.          POTENTIAL GTH-PBE-q11
  123.       &END KIND

  124.       &KIND Li
  125.          ELEMENT Li
  126.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  127.          POTENTIAL GTH-PBE-q3
  128.       &END KIND

  129.       &KIND Na
  130.          ELEMENT Na
  131.          BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
  132.          POTENTIAL GTH-PBE-q9
  133.       &END KIND

  134.    &END SUBSYS
  135.    ###################   END SUBSYS SECTION  ################
  136. &END FORCE_EVAL
  137. ######################   END FORCE_EVAL SECTION #####################

  138. #######################  3. MOTION SECTION  #########################
  139. #This section defines the contents for ion step
  140. &MOTION

  141.    &CELL_OPT
  142.       EXTERNAL_PRESSURE 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 1.0
  143.       KEEP_ANGLES T
  144.       KEEP_SYMMETRY T
  145.       OPTIMIZER CG
  146.       &CG
  147.          &LINE_SEARCH
  148.             TYPE 2PNT
  149.          &END LINE_SEARCH
  150.       &END CG
  151.   &END CELL_OPT

  152.    &GEO_OPT
  153.       MAX_ITER 400
  154.       OPTIMIZER BFGS
  155.       MAX_FORCE 6.0E-4
  156.    &END GEO_OPT

  157. &END MOTION
  158. #######################  END MOTION SECTION  #########################
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发表于 Post on 2022-6-22 20:37:49 | 只看该作者 Only view this author
BETA 1.5甭和前面的写到同一行

不熟悉的话就直接用Multiwfn产生输入文件,又省事格式又肯定没错误
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-22 20:47:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-22 20:37
BETA 1.5甭和前面的写到同一行

不熟悉的话就直接用Multiwfn产生输入文件,又省事格式又肯定没错误

好的卢老师 这就用起来

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