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[Gaussian/gview] 关于gaussian结构优化后续,结构修改后是否可以重新使用

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本帖最后由 文申的量子化学 于 2022-7-6 12:12 编辑

我按照论坛里的大佬在Chem3D的MM2先结构优化,后跑了能量最小化之后的出来的结构,各位大佬给看一下是不是结构就对上了。PO4,O与P键角都是统一的。

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发表于 Post on 2022-7-6 12:03:00 | 只看该作者 Only view this author
这种结构不大,真要一步一步的来,可以先用gfnff再DFT。GFNFF对MOF材料都加持效果。

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发表于 Post on 2022-7-6 14:59:37 | 只看该作者 Only view this author
乍看起来没有大问题。楼上说的GFN-FF可以试试,但是不是必需的。反正是预优化,如果经肉眼检查MM2优化的结构可信,就可以直接上DFT。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-6 20:21:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-6 14:59
乍看起来没有大问题。楼上说的GFN-FF可以试试,但是不是必需的。反正是预优化,如果经肉眼检查MM2优化的结 ...

谢谢老师我成功了

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发表于 Post on 2022-7-7 04:08:40 | 只看该作者 Only view this author
当前没问题,保存结构文件后记得把粉球所示的孤对电子给去掉
顺带嘱咐一下,MM2只适合成键方式普通的有机类体系,用MM2做预优化并不是普适的做法,别什么情况都拿MM2试图预优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-7 14:40:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-7 04:08
当前没问题,保存结构文件后记得把粉球所示的孤对电子给去掉
顺带嘱咐一下,MM2只适合成键方式普通的有机 ...

爱你哦,大佬!

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