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[新手求助] 求助含镧系金属Gd的溶解自由能计算的基组选择

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楼主
sob老师,想请问一下,在算镧系金属Gd的180原子左右的配合物的溶解自由能时可用选用什么基组?我们根据您的http://sobereva.com/327这篇帖子考虑用M062X/6-31G*的水平计算。但由于6-31G*对镧系金属没有定义。又根据帖子中提到的“如果6-31G*对当前算的过渡金属没有定义的话,用其它恰当的赝势基组也可以,诸如SDD、Lanl2TZ(f)等”,我们考虑对其他原子用6-31G*而对Gd用SDD想问一下这样选择是否合适?或者有没有更优的一些计算水平?

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发表于 Post on 2022-7-14 01:36:19 | 只看该作者 Only view this author
可以。此外注意对Gd以及任何带显著电荷、和溶剂之间有很强的氢键的基团做显式溶剂化,并且最好做构象搜索
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-14 10:14:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-14 01:36
可以。此外注意对Gd以及任何带显著电荷、和溶剂之间有很强的氢键的基团做显式溶剂化,并且最好做构象搜索

好的,谢谢您

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发表于 Post on 2023-3-1 11:43:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-14 01:36
可以。此外注意对Gd以及任何带显著电荷、和溶剂之间有很强的氢键的基团做显式溶剂化,并且最好做构象搜索

老师您好,如果做构象搜索,需要批量优化,找较低能量的过程也用这种计算精度吗?计算量会很大,这一步有推荐更低精度的方法吗?感谢老师!

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发表于 Post on 2023-3-1 16:57:14 | 只看该作者 Only view this author
wangzh 发表于 2023-3-1 04:43
老师您好,如果做构象搜索,需要批量优化,找较低能量的过程也用这种计算精度吗?计算量会很大,这一步有 ...

构象搜索可以用GFN2-xTB,批量优化还是得用你说的这个水平,基本没什么降低的空间了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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