如何使用有机溶液溶液化脂双层添加

free3hao · 发表于 Post on 2022-7-14 15:57:45

用Sobtop程序让有机分子产生了top，gro，itp文件，然后想用gmx_mpi insert-molecules程序给脂双层+水的盒子插入有机分子，但是“gmx_mpi insert-molecules -f box.gro -ci met.gro -nmol 299 -o in.gro"里”-nmol 299“的299好像代表个数不是浓度，所以想请教大佬，如何在脂双层中插入一定浓度的有机溶液。

喵星大佬 · 发表于 Post on 2022-7-14 16:11:54

根据盒子大小自己算一下要插多少个

free3hao · 发表于 Post on 2022-7-14 17:11:03

本帖最后由 free3hao 于 2022-7-14 19:12 编辑

喵星大佬发表于 2022-7-14 16:11
根据盒子大小自己算一下要插多少个

我是模拟模拟浓度下的，这能根据盒子大小计算吗

free3hao · 发表于 Post on 2022-7-14 19:11:49

喵星大佬发表于 2022-7-14 16:11
根据盒子大小自己算一下要插多少个

谢谢大佬，突然就想明白了

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