求助：lammps怎么输出带有group-id的分子轨迹文件？

vallen · 发表于 Post on 2022-8-6 10:17:53

比如，要模拟的体系的所有原子分成了两个组（a和b），怎么使输出的轨迹文件里面包含组名这一信息呢？比如有一列是group-id, 里面是a和b。

我看dump命令里面输出的都没有这一项，只能输出atom-id，type等
请各位高手赐教，谢谢！

liuhang0728 · 发表于 Post on 2022-8-7 20:00:49

可以用variable定义一个变量，gmask函数可以判断原子是否属于某个group

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[Lammps] 求助：lammps怎么输出带有group-id的分子轨迹文件？