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[综合交流] 想请教各位老师为啥过渡态优化要不然跑不到想要的结构,要不然SCF不收敛?

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各位老师好,我目前在计算高价金属四价钴[Co=O(H2O)5]2+氧化氯离子Cl-生成次氯酸的反应过渡态。推测的反应机理是四价钴先和Cl-配位然后将Cl-的电子部分夺走之后(接近Cl+),然后再发生水解生成HOCl。但是优化出来的过渡态只有Co-Cl键的断裂比较合理但Cl-O键的生成明显不对。因为在跑完IRC之后Co-Cl键从2.27埃增大到2.6,但是Cl-O键只从3.7减小到2.4就不再减小了。而实际上次氯酸中的O-Cl键长为1.7。(另外对于H2O水解之后产生的H+我另外放了一分子H2O在旁边从而生成H3O+)。后来我又尝试了将四价钴中的Co=O键先质子化(因为有文献报道说Co=O先质子化再发生反应Applied Catalysis B: Environmental 300 (2022) 120722)然后再跑过渡态,但是要么就是在优化过程中Cl明显偏向Co从而形成Co-Cl键(TS优化过程中就变成2.3埃,而O-Cl键则3.几埃),要不就是O-Cl整体一起远离Co(Co-Cl键3.几,而O-Cl键1.7几),而当调整初始结构让Co-Cl和O-Cl都在2.4几埃左右稍微比较合适的位置时,SCF又不收敛了。基组换成6-31g*,能级移动vshift=400也不行。相关的log文件我都放在附件里面了,希望老师们能帮我看看到底是哪儿出了问题啊,还有应该往哪方面调整啊?感谢老师们了。(后面两张图分别是未质子化的Co和质子化的Co)



202208241132294437..png (33.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

202208241132294437..png

202208241131104253..png (32.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

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ProtonationCo(IV)Co-ClbonddecreaseO-Clbondincrease.zip

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发表于 Post on 2022-8-24 15:36:10 | 只看该作者 Only view this author
看了下不收敛的那个结构,应该是电荷搞错了吧?这个体系的电荷是+1,不是+3
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-24 16:00:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-24 15:36
看了下不收敛的那个结构,应该是电荷搞错了吧?这个体系的电荷是+1,不是+3

老师,应该是+3没错,因为四价钴[Co=O(H2O)5]2+本身是带2个正电的,质子化了之后带4个正电,当和Cl-离子配位之后应该就是带三个正电

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-24 16:14:08 | 只看该作者 Only view this author
为了排除Co的影响,我刚刚又做了下Cl+离子和H2O单独生成HOCl的反应,发现它的过渡态的虚频根本不是O-Cl键生成和O-H键断裂,而只是两个O-H键在摆动(文件见下)。而对于Cl+这个东西我确实是在很多文献中看到说在HOCl氧化无机物的过程中,很多都会发生Cl+和无机物结合的反应,随后水解再发生无机物的氧化和Cl-的脱去(Reactions of chlorine with inorganic and organic compounds during water treatment-Kinetics and mechanisms: A critical review. Water Res. 2008, 42 (1−2), 13− 51.),而我想探究的反应其实是这个反应的逆过程,即Co=O氧化Cl-再变成HOCl,而且实验也确实证实是有大量HOCl生成的,所以真的感觉挺懵的,不知道哪里出了问题?

202208241613526064..png (228.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

202208241613526064..png

pureCl5.log

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发表于 Post on 2022-8-24 21:49:44 | 只看该作者 Only view this author
white-album 发表于 2022-8-24 09:00
老师,应该是+3没错,因为四价钴[Co=O(H2O)5]2+本身是带2个正电的,质子化了之后带4个正电,当和Cl-离子 ...

明白了,你这是+4价Co,但是那样的话O上能上两个质子吗?总感觉有点困难,因为第一过渡周期的+4价金属水合离子感觉应该都很容易掉质子形成羟基配合物吧
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-25 12:23:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-24 21:49
明白了,你这是+4价Co,但是那样的话O上能上两个质子吗?总感觉有点困难,因为第一过渡周期的+4价金属水 ...

因为它的Co=O键不稳定氧化性很强所以,上了两个H+应该就会立刻氧化其他物质了

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发表于 Post on 2022-8-25 16:02:34 | 只看该作者 Only view this author
white-album 发表于 2022-8-25 05:23
因为它的Co=O键不稳定氧化性很强所以,上了两个H+应该就会立刻氧化其他物质了

有没有算过上两个质子热力学上是否走得通?有可能只能上一个质子,而上一个质子就足够反应了
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-26 09:24:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-25 16:02
有没有算过上两个质子热力学上是否走得通?有可能只能上一个质子,而上一个质子就足够反应了

哦哦确实哈,这点倒是很有可能,谢谢老师!

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