gromacs跑动力学不一会cpu就降到1个核在算

mol · 发表于 Post on 2022-9-23 08:47:09

各位前辈好，小弟最近在gpu服务器用gromacs跑动力学，一开始12个线程交上，发现跑个几十ps就只剩下一个核在算了，用kill -9也杀不死进程。
应该不是作业的问题，在其他服务器上测试正常。
请问可能是哪方面的原因

mol · 发表于 Post on 2022-9-23 10:44:04

nvidia-smi看了下gpu的情况，提示Unable to determine the device handle for GPU 0000:02:00.0: GPU is lost. Reboot the system to recovery。重启机器后再次提交作业，同时watch nvidia-smi，发现温度达到91度，立马把kill掉任务，目前是十来分钟了，显卡温度还在65度

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-9-24 03:00:51

显然是GPU散热有问题，请检查风扇是否工作正常。如果是被动散热的计算卡，需要在服务器BIOS中设置散热模式。

mol · 发表于 Post on 2022-9-27 20:51:29

Entropy.S.I 发表于 2022-9-24 03:00
显然是GPU散热有问题，请检查风扇是否工作正常。如果是被动散热的计算卡，需要在服务器BIOS中设置散热模式 ...

谢谢您，拆下显卡看了下是有个风扇坏了

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