求助：用cp2k跑动力学，被超算管理员重新提交任务覆盖结果，怎么续算

AHU_cpc · 发表于 Post on 2022-9-27 00:14:05

各位老师，我的体系在超算上跑动力学两星期跑了500多步。今天晚上超算管理员修超算把所有任务挂起重新提交，我打开的时候.xyz文件已经被覆盖（文件大小变大了，但是用vmd打开只有20步了）我每20步保留了一个restart文件请问，这种情况可以续算么。
时间比较紧迫，恳请各位老师给予解答，万分感谢

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-27 01:53:40

看下文了解xyz文件格式，弄清楚当前xyz文件里记录了什么东西
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
http://sobereva.com/477

如果之前的一些帧的坐标都被覆盖了，那就没救了。如果之前那些帧的结构并不是你感兴趣的，就拿restart文件继续跑剩下的部分。

AHU_cpc · 发表于 Post on 2022-9-27 09:14:51

sobereva 发表于 2022-9-27 01:53
看下文了解xyz文件格式，弄清楚当前xyz文件里记录了什么东西
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
http://sobe ...

谢谢老师！

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